Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim35Q8C006 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim35Q8C006 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim35Q8C006 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim35Q8C006 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim35Q8C006 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim35Q8C006 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim35Q8C006 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim35Q8C006 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim35Q8C006 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim35Q8C006 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim35Q8C006 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim35Q8C006 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim35Q8C006 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim35Q8C006 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim35Q8C006 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim35Q8C006 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim35Q8C006 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim35Q8C006 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim35Q8C006 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim35Q8C006 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim35Q8C006 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim35Q8C006 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim35Q8C006 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim35Q8C006 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim35Q8C006 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim35Q8C006 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim35Q8C006 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim35Q8C006 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim35Q8C006 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim35Q8C006 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim35Q8C006 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim35Q8C006 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim35Q8C006 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim35Q8C006 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim35Q8C006 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim35Q8C006 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim35Q8C006 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim35Q8C006 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim35Q8C006 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim35Q8C006 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim35Q8C006 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim35Q8C006 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim35Q8C006 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim35Q8C006 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim35Q8C006 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim35Q8C006 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim35Q8C006 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim35Q8C006 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim35Q8C006 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim35Q8C006 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim35Q8C006 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim35Q8C006 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim35Q8C006 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim35Q8C006 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim35Q8C006 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim35Q8C006 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim35Q8C006 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim35Q8C006 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim35Q8C006 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Trim35Q8C006 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim35Q8C006 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim35Q8C006 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim35Q8C006 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim35Q8C006 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim35Q8C006 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim35Q8C006 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim35Q8C006 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim35Q8C006 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim35Q8C006 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim35Q8C006 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim35Q8C006 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim35Q8C006 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim35Q8C006 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim35Q8C006 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim35Q8C006 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim35Q8C006 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim35Q8C006 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim35Q8C006 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim35Q8C006 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim35Q8C006 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim35Q8C006 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim35Q8C006 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim35Q8C006 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim35Q8C006 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim35Q8C006 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim35Q8C006 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim35Q8C006 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim35Q8C006 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim35Q8C006 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim35Q8C006 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim35Q8C006 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim35Q8C006 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim35Q8C006 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim35Q8C006 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim35Q8C006 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim35Q8C006 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim35Q8C006 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim35Q8C006 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim35Q8C006 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms