Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK6

Ythdf3, YTH domain-containing family protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf3Q8BYK6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ythdf3Q8BYK6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ythdf3Q8BYK6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ythdf3Q8BYK6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ythdf3Q8BYK6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ythdf3Q8BYK6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ythdf3Q8BYK6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ythdf3Q8BYK6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ythdf3Q8BYK6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ythdf3Q8BYK6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ythdf3Q8BYK6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ythdf3Q8BYK6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ythdf3Q8BYK6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ythdf3Q8BYK6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ythdf3Q8BYK6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ythdf3Q8BYK6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ythdf3Q8BYK6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ythdf3Q8BYK6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ythdf3Q8BYK6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ythdf3Q8BYK6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ythdf3Q8BYK6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ythdf3Q8BYK6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ythdf3Q8BYK6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ythdf3Q8BYK6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ythdf3Q8BYK6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ythdf3Q8BYK6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ythdf3Q8BYK6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ythdf3Q8BYK6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ythdf3Q8BYK6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ythdf3Q8BYK6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ythdf3Q8BYK6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ythdf3Q8BYK6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ythdf3Q8BYK6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ythdf3Q8BYK6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ythdf3Q8BYK6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ythdf3Q8BYK6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ythdf3Q8BYK6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ythdf3Q8BYK6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ythdf3Q8BYK6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ythdf3Q8BYK6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ythdf3Q8BYK6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ythdf3Q8BYK6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ythdf3Q8BYK6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ythdf3Q8BYK6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ythdf3Q8BYK6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ythdf3Q8BYK6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ythdf3Q8BYK6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ythdf3Q8BYK6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ythdf3Q8BYK6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ythdf3Q8BYK6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ythdf3Q8BYK6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ythdf3Q8BYK6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ythdf3Q8BYK6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ythdf3Q8BYK6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ythdf3Q8BYK6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ythdf3Q8BYK6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ythdf3Q8BYK6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ythdf3Q8BYK6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ythdf3Q8BYK6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ythdf3Q8BYK6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ythdf3Q8BYK6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ythdf3Q8BYK6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ythdf3Q8BYK6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ythdf3Q8BYK6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ythdf3Q8BYK6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ythdf3Q8BYK6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ythdf3Q8BYK6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ythdf3Q8BYK6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ythdf3Q8BYK6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ythdf3Q8BYK6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ythdf3Q8BYK6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ythdf3Q8BYK6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ythdf3Q8BYK6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ythdf3Q8BYK6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ythdf3Q8BYK6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ythdf3Q8BYK6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ythdf3Q8BYK6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ythdf3Q8BYK6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ythdf3Q8BYK6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ythdf3Q8BYK6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ythdf3Q8BYK6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ythdf3Q8BYK6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ythdf3Q8BYK6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ythdf3Q8BYK6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ythdf3Q8BYK6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ythdf3Q8BYK6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ythdf3Q8BYK6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ythdf3Q8BYK6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ythdf3Q8BYK6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ythdf3Q8BYK6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ythdf3Q8BYK6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ythdf3Q8BYK6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ythdf3Q8BYK6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ythdf3Q8BYK6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ythdf3Q8BYK6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ythdf3Q8BYK6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ythdf3Q8BYK6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ythdf3Q8BYK6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ythdf3Q8BYK6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ythdf3Q8BYK6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 763.9 ms