Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trerf1Q8BXJ2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trerf1Q8BXJ2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trerf1Q8BXJ2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trerf1Q8BXJ2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trerf1Q8BXJ2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trerf1Q8BXJ2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Trerf1Q8BXJ2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trerf1Q8BXJ2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trerf1Q8BXJ2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trerf1Q8BXJ2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trerf1Q8BXJ2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trerf1Q8BXJ2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trerf1Q8BXJ2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trerf1Q8BXJ2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Trerf1Q8BXJ2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trerf1Q8BXJ2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trerf1Q8BXJ2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trerf1Q8BXJ2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trerf1Q8BXJ2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trerf1Q8BXJ2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trerf1Q8BXJ2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Trerf1Q8BXJ2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trerf1Q8BXJ2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trerf1Q8BXJ2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trerf1Q8BXJ2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trerf1Q8BXJ2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trerf1Q8BXJ2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trerf1Q8BXJ2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trerf1Q8BXJ2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Trerf1Q8BXJ2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trerf1Q8BXJ2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trerf1Q8BXJ2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trerf1Q8BXJ2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trerf1Q8BXJ2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trerf1Q8BXJ2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trerf1Q8BXJ2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trerf1Q8BXJ2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trerf1Q8BXJ2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trerf1Q8BXJ2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Trerf1Q8BXJ2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trerf1Q8BXJ2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trerf1Q8BXJ2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trerf1Q8BXJ2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trerf1Q8BXJ2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Trerf1Q8BXJ2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trerf1Q8BXJ2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trerf1Q8BXJ2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trerf1Q8BXJ2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trerf1Q8BXJ2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trerf1Q8BXJ2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trerf1Q8BXJ2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trerf1Q8BXJ2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trerf1Q8BXJ2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Trerf1Q8BXJ2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trerf1Q8BXJ2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trerf1Q8BXJ2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trerf1Q8BXJ2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trerf1Q8BXJ2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trerf1Q8BXJ2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trerf1Q8BXJ2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trerf1Q8BXJ2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trerf1Q8BXJ2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trerf1Q8BXJ2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trerf1Q8BXJ2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trerf1Q8BXJ2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trerf1Q8BXJ2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trerf1Q8BXJ2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trerf1Q8BXJ2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trerf1Q8BXJ2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trerf1Q8BXJ2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trerf1Q8BXJ2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trerf1Q8BXJ2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trerf1Q8BXJ2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trerf1Q8BXJ2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Trerf1Q8BXJ2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trerf1Q8BXJ2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trerf1Q8BXJ2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trerf1Q8BXJ2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trerf1Q8BXJ2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trerf1Q8BXJ2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trerf1Q8BXJ2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trerf1Q8BXJ2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trerf1Q8BXJ2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trerf1Q8BXJ2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trerf1Q8BXJ2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trerf1Q8BXJ2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trerf1Q8BXJ2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trerf1Q8BXJ2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trerf1Q8BXJ2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trerf1Q8BXJ2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trerf1Q8BXJ2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trerf1Q8BXJ2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trerf1Q8BXJ2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trerf1Q8BXJ2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trerf1Q8BXJ2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trerf1Q8BXJ2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trerf1Q8BXJ2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trerf1Q8BXJ2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trerf1Q8BXJ2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
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