Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ccdc30Q8BVF4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ccdc30Q8BVF4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ccdc30Q8BVF4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ccdc30Q8BVF4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ccdc30Q8BVF4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ccdc30Q8BVF4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Ccdc30Q8BVF4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ccdc30Q8BVF4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ccdc30Q8BVF4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ccdc30Q8BVF4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ccdc30Q8BVF4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ccdc30Q8BVF4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ccdc30Q8BVF4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ccdc30Q8BVF4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ccdc30Q8BVF4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ccdc30Q8BVF4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ccdc30Q8BVF4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ccdc30Q8BVF4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ccdc30Q8BVF4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ccdc30Q8BVF4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ccdc30Q8BVF4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ccdc30Q8BVF4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ccdc30Q8BVF4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ccdc30Q8BVF4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ccdc30Q8BVF4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ccdc30Q8BVF4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Ccdc30Q8BVF4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ccdc30Q8BVF4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ccdc30Q8BVF4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ccdc30Q8BVF4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ccdc30Q8BVF4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ccdc30Q8BVF4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ccdc30Q8BVF4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ccdc30Q8BVF4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ccdc30Q8BVF4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ccdc30Q8BVF4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ccdc30Q8BVF4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ccdc30Q8BVF4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Ccdc30Q8BVF4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Ccdc30Q8BVF4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ccdc30Q8BVF4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Ccdc30Q8BVF4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Ccdc30Q8BVF4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ccdc30Q8BVF4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ccdc30Q8BVF4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ccdc30Q8BVF4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ccdc30Q8BVF4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ccdc30Q8BVF4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Ccdc30Q8BVF4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ccdc30Q8BVF4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ccdc30Q8BVF4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ccdc30Q8BVF4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ccdc30Q8BVF4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ccdc30Q8BVF4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ccdc30Q8BVF4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ccdc30Q8BVF4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccdc30Q8BVF4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ccdc30Q8BVF4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ccdc30Q8BVF4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ccdc30Q8BVF4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ccdc30Q8BVF4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ccdc30Q8BVF4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ccdc30Q8BVF4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ccdc30Q8BVF4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ccdc30Q8BVF4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ccdc30Q8BVF4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ccdc30Q8BVF4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ccdc30Q8BVF4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ccdc30Q8BVF4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ccdc30Q8BVF4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ccdc30Q8BVF4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ccdc30Q8BVF4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ccdc30Q8BVF4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ccdc30Q8BVF4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ccdc30Q8BVF4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ccdc30Q8BVF4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ccdc30Q8BVF4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ccdc30Q8BVF4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ccdc30Q8BVF4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ccdc30Q8BVF4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ccdc30Q8BVF4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ccdc30Q8BVF4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ccdc30Q8BVF4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ccdc30Q8BVF4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ccdc30Q8BVF4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ccdc30Q8BVF4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ccdc30Q8BVF4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ccdc30Q8BVF4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ccdc30Q8BVF4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ccdc30Q8BVF4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ccdc30Q8BVF4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ccdc30Q8BVF4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ccdc30Q8BVF4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ccdc30Q8BVF4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ccdc30Q8BVF4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc30Q8BVF4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc30Q8BVF4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc30Q8BVF4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc30Q8BVF4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms