Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cops7bQ8BV13 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cops7bQ8BV13 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cops7bQ8BV13 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cops7bQ8BV13 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cops7bQ8BV13 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cops7bQ8BV13 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cops7bQ8BV13 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cops7bQ8BV13 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cops7bQ8BV13 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cops7bQ8BV13 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cops7bQ8BV13 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cops7bQ8BV13 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cops7bQ8BV13 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cops7bQ8BV13 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cops7bQ8BV13 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cops7bQ8BV13 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cops7bQ8BV13 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cops7bQ8BV13 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cops7bQ8BV13 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cops7bQ8BV13 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cops7bQ8BV13 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cops7bQ8BV13 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cops7bQ8BV13 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cops7bQ8BV13 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cops7bQ8BV13 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cops7bQ8BV13 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cops7bQ8BV13 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cops7bQ8BV13 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cops7bQ8BV13 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cops7bQ8BV13 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cops7bQ8BV13 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cops7bQ8BV13 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cops7bQ8BV13 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cops7bQ8BV13 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cops7bQ8BV13 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cops7bQ8BV13 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cops7bQ8BV13 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cops7bQ8BV13 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cops7bQ8BV13 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cops7bQ8BV13 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cops7bQ8BV13 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cops7bQ8BV13 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cops7bQ8BV13 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cops7bQ8BV13 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cops7bQ8BV13 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cops7bQ8BV13 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cops7bQ8BV13 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cops7bQ8BV13 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cops7bQ8BV13 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cops7bQ8BV13 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cops7bQ8BV13 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cops7bQ8BV13 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cops7bQ8BV13 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cops7bQ8BV13 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cops7bQ8BV13 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cops7bQ8BV13 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cops7bQ8BV13 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cops7bQ8BV13 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cops7bQ8BV13 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cops7bQ8BV13 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cops7bQ8BV13 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cops7bQ8BV13 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cops7bQ8BV13 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cops7bQ8BV13 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cops7bQ8BV13 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cops7bQ8BV13 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cops7bQ8BV13 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cops7bQ8BV13 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cops7bQ8BV13 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cops7bQ8BV13 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cops7bQ8BV13 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cops7bQ8BV13 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cops7bQ8BV13 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cops7bQ8BV13 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cops7bQ8BV13 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cops7bQ8BV13 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cops7bQ8BV13 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cops7bQ8BV13 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cops7bQ8BV13 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cops7bQ8BV13 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cops7bQ8BV13 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cops7bQ8BV13 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cops7bQ8BV13 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cops7bQ8BV13 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cops7bQ8BV13 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cops7bQ8BV13 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cops7bQ8BV13 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cops7bQ8BV13 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cops7bQ8BV13 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cops7bQ8BV13 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cops7bQ8BV13 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cops7bQ8BV13 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cops7bQ8BV13 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cops7bQ8BV13 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cops7bQ8BV13 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cops7bQ8BV13 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cops7bQ8BV13 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cops7bQ8BV13 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cops7bQ8BV13 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms