Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSF5

Klhl38, Kelch-like protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl38Q8BSF5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Klhl38Q8BSF5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Klhl38Q8BSF5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl38Q8BSF5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl38Q8BSF5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klhl38Q8BSF5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klhl38Q8BSF5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klhl38Q8BSF5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klhl38Q8BSF5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klhl38Q8BSF5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klhl38Q8BSF5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klhl38Q8BSF5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klhl38Q8BSF5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klhl38Q8BSF5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klhl38Q8BSF5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klhl38Q8BSF5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klhl38Q8BSF5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Klhl38Q8BSF5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Klhl38Q8BSF5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Klhl38Q8BSF5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Klhl38Q8BSF5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Klhl38Q8BSF5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klhl38Q8BSF5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klhl38Q8BSF5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klhl38Q8BSF5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klhl38Q8BSF5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klhl38Q8BSF5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klhl38Q8BSF5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhl38Q8BSF5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhl38Q8BSF5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klhl38Q8BSF5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klhl38Q8BSF5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klhl38Q8BSF5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klhl38Q8BSF5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Klhl38Q8BSF5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Klhl38Q8BSF5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klhl38Q8BSF5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klhl38Q8BSF5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhl38Q8BSF5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhl38Q8BSF5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klhl38Q8BSF5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klhl38Q8BSF5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhl38Q8BSF5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhl38Q8BSF5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhl38Q8BSF5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhl38Q8BSF5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhl38Q8BSF5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klhl38Q8BSF5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klhl38Q8BSF5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klhl38Q8BSF5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhl38Q8BSF5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhl38Q8BSF5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhl38Q8BSF5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhl38Q8BSF5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhl38Q8BSF5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klhl38Q8BSF5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klhl38Q8BSF5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klhl38Q8BSF5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhl38Q8BSF5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhl38Q8BSF5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhl38Q8BSF5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klhl38Q8BSF5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Klhl38Q8BSF5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Klhl38Q8BSF5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klhl38Q8BSF5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klhl38Q8BSF5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Klhl38Q8BSF5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klhl38Q8BSF5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klhl38Q8BSF5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klhl38Q8BSF5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klhl38Q8BSF5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klhl38Q8BSF5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klhl38Q8BSF5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klhl38Q8BSF5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klhl38Q8BSF5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klhl38Q8BSF5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klhl38Q8BSF5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Klhl38Q8BSF5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Klhl38Q8BSF5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klhl38Q8BSF5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klhl38Q8BSF5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klhl38Q8BSF5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klhl38Q8BSF5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klhl38Q8BSF5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klhl38Q8BSF5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Klhl38Q8BSF5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhl38Q8BSF5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhl38Q8BSF5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhl38Q8BSF5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhl38Q8BSF5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhl38Q8BSF5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhl38Q8BSF5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhl38Q8BSF5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhl38Q8BSF5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhl38Q8BSF5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhl38Q8BSF5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhl38Q8BSF5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhl38Q8BSF5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Klhl38Q8BSF5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klhl38Q8BSF5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms