Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q8BP99 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q8BP99 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q8BP99 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q8BP99 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q8BP99 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q8BP99 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q8BP99 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q8BP99 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q8BP99 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q8BP99 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q8BP99 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q8BP99 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q8BP99 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q8BP99 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q8BP99 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q8BP99 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8BP99 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8BP99 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q8BP99 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q8BP99 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q8BP99 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q8BP99 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q8BP99 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q8BP99 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q8BP99 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q8BP99 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q8BP99 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q8BP99 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8BP99 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q8BP99 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q8BP99 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q8BP99 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q8BP99 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q8BP99 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q8BP99 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8BP99 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8BP99 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q8BP99 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q8BP99 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Q8BP99 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q8BP99 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q8BP99 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q8BP99 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q8BP99 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q8BP99 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q8BP99 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q8BP99 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q8BP99 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q8BP99 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q8BP99 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q8BP99 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q8BP99 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q8BP99 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q8BP99 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8BP99 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8BP99 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8BP99 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8BP99 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8BP99 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8BP99 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q8BP99 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q8BP99 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q8BP99 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q8BP99 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Q8BP99 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q8BP99 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q8BP99 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q8BP99 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q8BP99 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q8BP99 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q8BP99 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q8BP99 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q8BP99 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q8BP99 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q8BP99 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Q8BP99 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q8BP99 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q8BP99 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q8BP99 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q8BP99 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q8BP99 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q8BP99 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q8BP99 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q8BP99 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q8BP99 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q8BP99 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q8BP99 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q8BP99 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q8BP99 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q8BP99 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Q8BP99 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q8BP99 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Q8BP99 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q8BP99 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q8BP99 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q8BP99 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q8BP99 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q8BP99 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q8BP99 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms