Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKF1

Polrmt, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolrmtQ8BKF1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PolrmtQ8BKF1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PolrmtQ8BKF1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PolrmtQ8BKF1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PolrmtQ8BKF1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PolrmtQ8BKF1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PolrmtQ8BKF1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PolrmtQ8BKF1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PolrmtQ8BKF1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PolrmtQ8BKF1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PolrmtQ8BKF1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PolrmtQ8BKF1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PolrmtQ8BKF1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PolrmtQ8BKF1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PolrmtQ8BKF1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PolrmtQ8BKF1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PolrmtQ8BKF1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PolrmtQ8BKF1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PolrmtQ8BKF1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PolrmtQ8BKF1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PolrmtQ8BKF1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PolrmtQ8BKF1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PolrmtQ8BKF1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PolrmtQ8BKF1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PolrmtQ8BKF1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PolrmtQ8BKF1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PolrmtQ8BKF1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PolrmtQ8BKF1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PolrmtQ8BKF1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PolrmtQ8BKF1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PolrmtQ8BKF1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PolrmtQ8BKF1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PolrmtQ8BKF1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PolrmtQ8BKF1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PolrmtQ8BKF1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PolrmtQ8BKF1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PolrmtQ8BKF1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PolrmtQ8BKF1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PolrmtQ8BKF1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PolrmtQ8BKF1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PolrmtQ8BKF1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PolrmtQ8BKF1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PolrmtQ8BKF1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PolrmtQ8BKF1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PolrmtQ8BKF1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PolrmtQ8BKF1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PolrmtQ8BKF1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PolrmtQ8BKF1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PolrmtQ8BKF1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PolrmtQ8BKF1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PolrmtQ8BKF1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PolrmtQ8BKF1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PolrmtQ8BKF1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PolrmtQ8BKF1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PolrmtQ8BKF1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PolrmtQ8BKF1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PolrmtQ8BKF1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PolrmtQ8BKF1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PolrmtQ8BKF1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PolrmtQ8BKF1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PolrmtQ8BKF1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PolrmtQ8BKF1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PolrmtQ8BKF1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PolrmtQ8BKF1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PolrmtQ8BKF1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PolrmtQ8BKF1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PolrmtQ8BKF1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PolrmtQ8BKF1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PolrmtQ8BKF1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PolrmtQ8BKF1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PolrmtQ8BKF1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PolrmtQ8BKF1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PolrmtQ8BKF1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PolrmtQ8BKF1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PolrmtQ8BKF1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PolrmtQ8BKF1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PolrmtQ8BKF1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PolrmtQ8BKF1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PolrmtQ8BKF1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PolrmtQ8BKF1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PolrmtQ8BKF1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PolrmtQ8BKF1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PolrmtQ8BKF1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PolrmtQ8BKF1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PolrmtQ8BKF1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PolrmtQ8BKF1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PolrmtQ8BKF1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PolrmtQ8BKF1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PolrmtQ8BKF1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PolrmtQ8BKF1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PolrmtQ8BKF1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PolrmtQ8BKF1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PolrmtQ8BKF1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PolrmtQ8BKF1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PolrmtQ8BKF1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PolrmtQ8BKF1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PolrmtQ8BKF1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PolrmtQ8BKF1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PolrmtQ8BKF1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PolrmtQ8BKF1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms