Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nop53Q8BK35 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Nop53Q8BK35 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nop53Q8BK35 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nop53Q8BK35 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nop53Q8BK35 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nop53Q8BK35 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nop53Q8BK35 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nop53Q8BK35 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nop53Q8BK35 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nop53Q8BK35 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nop53Q8BK35 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nop53Q8BK35 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nop53Q8BK35 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nop53Q8BK35 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nop53Q8BK35 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nop53Q8BK35 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nop53Q8BK35 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nop53Q8BK35 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nop53Q8BK35 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nop53Q8BK35 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nop53Q8BK35 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nop53Q8BK35 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nop53Q8BK35 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nop53Q8BK35 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Nop53Q8BK35 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nop53Q8BK35 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nop53Q8BK35 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nop53Q8BK35 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nop53Q8BK35 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nop53Q8BK35 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nop53Q8BK35 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nop53Q8BK35 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nop53Q8BK35 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nop53Q8BK35 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nop53Q8BK35 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nop53Q8BK35 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nop53Q8BK35 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Nop53Q8BK35 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nop53Q8BK35 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nop53Q8BK35 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nop53Q8BK35 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nop53Q8BK35 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nop53Q8BK35 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nop53Q8BK35 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nop53Q8BK35 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nop53Q8BK35 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nop53Q8BK35 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nop53Q8BK35 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nop53Q8BK35 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nop53Q8BK35 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nop53Q8BK35 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nop53Q8BK35 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nop53Q8BK35 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nop53Q8BK35 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nop53Q8BK35 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nop53Q8BK35 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nop53Q8BK35 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nop53Q8BK35 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nop53Q8BK35 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nop53Q8BK35 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nop53Q8BK35 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nop53Q8BK35 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nop53Q8BK35 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nop53Q8BK35 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nop53Q8BK35 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nop53Q8BK35 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nop53Q8BK35 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nop53Q8BK35 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nop53Q8BK35 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nop53Q8BK35 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nop53Q8BK35 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nop53Q8BK35 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nop53Q8BK35 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nop53Q8BK35 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nop53Q8BK35 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nop53Q8BK35 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nop53Q8BK35 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nop53Q8BK35 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nop53Q8BK35 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nop53Q8BK35 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nop53Q8BK35 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nop53Q8BK35 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Nop53Q8BK35 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nop53Q8BK35 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nop53Q8BK35 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nop53Q8BK35 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Nop53Q8BK35 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nop53Q8BK35 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nop53Q8BK35 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nop53Q8BK35 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nop53Q8BK35 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nop53Q8BK35 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nop53Q8BK35 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nop53Q8BK35 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nop53Q8BK35 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nop53Q8BK35 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nop53Q8BK35 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nop53Q8BK35 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nop53Q8BK35 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms