Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cyp4f39Q8BGU0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cyp4f39Q8BGU0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cyp4f39Q8BGU0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cyp4f39Q8BGU0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cyp4f39Q8BGU0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cyp4f39Q8BGU0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cyp4f39Q8BGU0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cyp4f39Q8BGU0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cyp4f39Q8BGU0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cyp4f39Q8BGU0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cyp4f39Q8BGU0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cyp4f39Q8BGU0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Cyp4f39Q8BGU0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cyp4f39Q8BGU0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cyp4f39Q8BGU0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cyp4f39Q8BGU0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cyp4f39Q8BGU0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cyp4f39Q8BGU0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cyp4f39Q8BGU0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cyp4f39Q8BGU0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cyp4f39Q8BGU0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cyp4f39Q8BGU0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cyp4f39Q8BGU0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Cyp4f39Q8BGU0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cyp4f39Q8BGU0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cyp4f39Q8BGU0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cyp4f39Q8BGU0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cyp4f39Q8BGU0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cyp4f39Q8BGU0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cyp4f39Q8BGU0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cyp4f39Q8BGU0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cyp4f39Q8BGU0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cyp4f39Q8BGU0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cyp4f39Q8BGU0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cyp4f39Q8BGU0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cyp4f39Q8BGU0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cyp4f39Q8BGU0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cyp4f39Q8BGU0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cyp4f39Q8BGU0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cyp4f39Q8BGU0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cyp4f39Q8BGU0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cyp4f39Q8BGU0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cyp4f39Q8BGU0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cyp4f39Q8BGU0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cyp4f39Q8BGU0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cyp4f39Q8BGU0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Cyp4f39Q8BGU0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cyp4f39Q8BGU0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cyp4f39Q8BGU0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cyp4f39Q8BGU0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cyp4f39Q8BGU0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cyp4f39Q8BGU0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cyp4f39Q8BGU0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cyp4f39Q8BGU0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cyp4f39Q8BGU0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cyp4f39Q8BGU0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cyp4f39Q8BGU0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cyp4f39Q8BGU0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cyp4f39Q8BGU0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cyp4f39Q8BGU0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cyp4f39Q8BGU0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cyp4f39Q8BGU0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cyp4f39Q8BGU0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cyp4f39Q8BGU0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cyp4f39Q8BGU0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cyp4f39Q8BGU0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cyp4f39Q8BGU0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cyp4f39Q8BGU0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cyp4f39Q8BGU0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cyp4f39Q8BGU0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cyp4f39Q8BGU0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cyp4f39Q8BGU0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cyp4f39Q8BGU0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cyp4f39Q8BGU0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cyp4f39Q8BGU0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cyp4f39Q8BGU0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cyp4f39Q8BGU0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cyp4f39Q8BGU0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cyp4f39Q8BGU0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Cyp4f39Q8BGU0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cyp4f39Q8BGU0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Cyp4f39Q8BGU0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cyp4f39Q8BGU0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cyp4f39Q8BGU0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cyp4f39Q8BGU0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cyp4f39Q8BGU0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cyp4f39Q8BGU0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Cyp4f39Q8BGU0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cyp4f39Q8BGU0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cyp4f39Q8BGU0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cyp4f39Q8BGU0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms