Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU5

Ccdc181, Coiled-coil domain-containing protein 181, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc181Q80ZU5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc181Q80ZU5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc181Q80ZU5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc181Q80ZU5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc181Q80ZU5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc181Q80ZU5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc181Q80ZU5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc181Q80ZU5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc181Q80ZU5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc181Q80ZU5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc181Q80ZU5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc181Q80ZU5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc181Q80ZU5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc181Q80ZU5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc181Q80ZU5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc181Q80ZU5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc181Q80ZU5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc181Q80ZU5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc181Q80ZU5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc181Q80ZU5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc181Q80ZU5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc181Q80ZU5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc181Q80ZU5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc181Q80ZU5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc181Q80ZU5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc181Q80ZU5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc181Q80ZU5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc181Q80ZU5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc181Q80ZU5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc181Q80ZU5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc181Q80ZU5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc181Q80ZU5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc181Q80ZU5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc181Q80ZU5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc181Q80ZU5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc181Q80ZU5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc181Q80ZU5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc181Q80ZU5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc181Q80ZU5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc181Q80ZU5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc181Q80ZU5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc181Q80ZU5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc181Q80ZU5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc181Q80ZU5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc181Q80ZU5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc181Q80ZU5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc181Q80ZU5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc181Q80ZU5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc181Q80ZU5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc181Q80ZU5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc181Q80ZU5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc181Q80ZU5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc181Q80ZU5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc181Q80ZU5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc181Q80ZU5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc181Q80ZU5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc181Q80ZU5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc181Q80ZU5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc181Q80ZU5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc181Q80ZU5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc181Q80ZU5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc181Q80ZU5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc181Q80ZU5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc181Q80ZU5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc181Q80ZU5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc181Q80ZU5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc181Q80ZU5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc181Q80ZU5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc181Q80ZU5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc181Q80ZU5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc181Q80ZU5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc181Q80ZU5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc181Q80ZU5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc181Q80ZU5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc181Q80ZU5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc181Q80ZU5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc181Q80ZU5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc181Q80ZU5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc181Q80ZU5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc181Q80ZU5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc181Q80ZU5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc181Q80ZU5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc181Q80ZU5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc181Q80ZU5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc181Q80ZU5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc181Q80ZU5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc181Q80ZU5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc181Q80ZU5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc181Q80ZU5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc181Q80ZU5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc181Q80ZU5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc181Q80ZU5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc181Q80ZU5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc181Q80ZU5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc181Q80ZU5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc181Q80ZU5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc181Q80ZU5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc181Q80ZU5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc181Q80ZU5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc181Q80ZU5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms