Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smim19Q80ZU4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smim19Q80ZU4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smim19Q80ZU4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smim19Q80ZU4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim19Q80ZU4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim19Q80ZU4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim19Q80ZU4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim19Q80ZU4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim19Q80ZU4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim19Q80ZU4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim19Q80ZU4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Smim19Q80ZU4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smim19Q80ZU4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smim19Q80ZU4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Smim19Q80ZU4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Smim19Q80ZU4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smim19Q80ZU4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smim19Q80ZU4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim19Q80ZU4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smim19Q80ZU4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smim19Q80ZU4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smim19Q80ZU4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smim19Q80ZU4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim19Q80ZU4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim19Q80ZU4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim19Q80ZU4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim19Q80ZU4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim19Q80ZU4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim19Q80ZU4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim19Q80ZU4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim19Q80ZU4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim19Q80ZU4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim19Q80ZU4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim19Q80ZU4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim19Q80ZU4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim19Q80ZU4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim19Q80ZU4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim19Q80ZU4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim19Q80ZU4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim19Q80ZU4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim19Q80ZU4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim19Q80ZU4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim19Q80ZU4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim19Q80ZU4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim19Q80ZU4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim19Q80ZU4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim19Q80ZU4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Smim19Q80ZU4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim19Q80ZU4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim19Q80ZU4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim19Q80ZU4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim19Q80ZU4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim19Q80ZU4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim19Q80ZU4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim19Q80ZU4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim19Q80ZU4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim19Q80ZU4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim19Q80ZU4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim19Q80ZU4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim19Q80ZU4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim19Q80ZU4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim19Q80ZU4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim19Q80ZU4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim19Q80ZU4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smim19Q80ZU4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smim19Q80ZU4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smim19Q80ZU4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smim19Q80ZU4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smim19Q80ZU4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smim19Q80ZU4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim19Q80ZU4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim19Q80ZU4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smim19Q80ZU4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smim19Q80ZU4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smim19Q80ZU4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smim19Q80ZU4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim19Q80ZU4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim19Q80ZU4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim19Q80ZU4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim19Q80ZU4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim19Q80ZU4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim19Q80ZU4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim19Q80ZU4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smim19Q80ZU4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smim19Q80ZU4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smim19Q80ZU4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smim19Q80ZU4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smim19Q80ZU4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smim19Q80ZU4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smim19Q80ZU4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smim19Q80ZU4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smim19Q80ZU4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim19Q80ZU4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim19Q80ZU4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim19Q80ZU4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim19Q80ZU4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smim19Q80ZU4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim19Q80ZU4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smim19Q80ZU4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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