Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phf8Q80TJ7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phf8Q80TJ7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phf8Q80TJ7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Phf8Q80TJ7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Phf8Q80TJ7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Phf8Q80TJ7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Phf8Q80TJ7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Phf8Q80TJ7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Phf8Q80TJ7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Phf8Q80TJ7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Phf8Q80TJ7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Phf8Q80TJ7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phf8Q80TJ7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Phf8Q80TJ7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Phf8Q80TJ7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Phf8Q80TJ7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Phf8Q80TJ7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Phf8Q80TJ7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Phf8Q80TJ7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Phf8Q80TJ7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Phf8Q80TJ7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Phf8Q80TJ7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Phf8Q80TJ7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Phf8Q80TJ7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phf8Q80TJ7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Phf8Q80TJ7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Phf8Q80TJ7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Phf8Q80TJ7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Phf8Q80TJ7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Phf8Q80TJ7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Phf8Q80TJ7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Phf8Q80TJ7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Phf8Q80TJ7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Phf8Q80TJ7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Phf8Q80TJ7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Phf8Q80TJ7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Phf8Q80TJ7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Phf8Q80TJ7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Phf8Q80TJ7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Phf8Q80TJ7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Phf8Q80TJ7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Phf8Q80TJ7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Phf8Q80TJ7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Phf8Q80TJ7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Phf8Q80TJ7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Phf8Q80TJ7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Phf8Q80TJ7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Phf8Q80TJ7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Phf8Q80TJ7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Phf8Q80TJ7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Phf8Q80TJ7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phf8Q80TJ7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phf8Q80TJ7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phf8Q80TJ7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phf8Q80TJ7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phf8Q80TJ7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Phf8Q80TJ7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Phf8Q80TJ7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Phf8Q80TJ7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Phf8Q80TJ7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Phf8Q80TJ7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Phf8Q80TJ7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Phf8Q80TJ7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phf8Q80TJ7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phf8Q80TJ7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phf8Q80TJ7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phf8Q80TJ7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phf8Q80TJ7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phf8Q80TJ7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phf8Q80TJ7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phf8Q80TJ7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phf8Q80TJ7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phf8Q80TJ7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phf8Q80TJ7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phf8Q80TJ7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phf8Q80TJ7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phf8Q80TJ7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phf8Q80TJ7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phf8Q80TJ7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phf8Q80TJ7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phf8Q80TJ7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phf8Q80TJ7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phf8Q80TJ7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phf8Q80TJ7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phf8Q80TJ7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phf8Q80TJ7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Phf8Q80TJ7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Phf8Q80TJ7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Phf8Q80TJ7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Phf8Q80TJ7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phf8Q80TJ7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phf8Q80TJ7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Phf8Q80TJ7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Phf8Q80TJ7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Phf8Q80TJ7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Phf8Q80TJ7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Phf8Q80TJ7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phf8Q80TJ7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phf8Q80TJ7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms