Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sgo2Q7TSY8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sgo2Q7TSY8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sgo2Q7TSY8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sgo2Q7TSY8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Sgo2Q7TSY8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sgo2Q7TSY8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sgo2Q7TSY8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sgo2Q7TSY8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sgo2Q7TSY8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sgo2Q7TSY8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sgo2Q7TSY8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sgo2Q7TSY8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sgo2Q7TSY8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sgo2Q7TSY8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sgo2Q7TSY8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sgo2Q7TSY8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sgo2Q7TSY8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sgo2Q7TSY8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sgo2Q7TSY8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sgo2Q7TSY8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sgo2Q7TSY8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sgo2Q7TSY8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sgo2Q7TSY8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sgo2Q7TSY8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sgo2Q7TSY8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sgo2Q7TSY8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sgo2Q7TSY8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sgo2Q7TSY8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sgo2Q7TSY8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sgo2Q7TSY8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sgo2Q7TSY8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sgo2Q7TSY8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sgo2Q7TSY8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sgo2Q7TSY8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sgo2Q7TSY8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sgo2Q7TSY8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sgo2Q7TSY8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sgo2Q7TSY8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sgo2Q7TSY8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sgo2Q7TSY8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sgo2Q7TSY8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sgo2Q7TSY8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sgo2Q7TSY8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sgo2Q7TSY8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sgo2Q7TSY8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sgo2Q7TSY8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sgo2Q7TSY8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sgo2Q7TSY8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sgo2Q7TSY8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sgo2Q7TSY8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sgo2Q7TSY8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sgo2Q7TSY8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sgo2Q7TSY8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sgo2Q7TSY8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Sgo2Q7TSY8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sgo2Q7TSY8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sgo2Q7TSY8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sgo2Q7TSY8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sgo2Q7TSY8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sgo2Q7TSY8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Sgo2Q7TSY8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sgo2Q7TSY8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sgo2Q7TSY8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sgo2Q7TSY8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sgo2Q7TSY8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sgo2Q7TSY8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sgo2Q7TSY8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sgo2Q7TSY8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sgo2Q7TSY8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sgo2Q7TSY8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sgo2Q7TSY8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sgo2Q7TSY8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sgo2Q7TSY8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sgo2Q7TSY8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sgo2Q7TSY8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sgo2Q7TSY8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sgo2Q7TSY8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sgo2Q7TSY8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sgo2Q7TSY8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sgo2Q7TSY8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sgo2Q7TSY8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sgo2Q7TSY8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sgo2Q7TSY8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sgo2Q7TSY8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sgo2Q7TSY8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sgo2Q7TSY8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sgo2Q7TSY8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sgo2Q7TSY8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sgo2Q7TSY8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sgo2Q7TSY8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sgo2Q7TSY8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sgo2Q7TSY8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sgo2Q7TSY8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sgo2Q7TSY8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sgo2Q7TSY8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sgo2Q7TSY8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sgo2Q7TSY8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sgo2Q7TSY8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sgo2Q7TSY8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms