Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSE6

Stk38l, Serine/threonine-protein kinase 38-like, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk38lQ7TSE6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stk38lQ7TSE6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stk38lQ7TSE6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stk38lQ7TSE6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stk38lQ7TSE6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stk38lQ7TSE6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Stk38lQ7TSE6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stk38lQ7TSE6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stk38lQ7TSE6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stk38lQ7TSE6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stk38lQ7TSE6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stk38lQ7TSE6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stk38lQ7TSE6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stk38lQ7TSE6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stk38lQ7TSE6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stk38lQ7TSE6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stk38lQ7TSE6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stk38lQ7TSE6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stk38lQ7TSE6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stk38lQ7TSE6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stk38lQ7TSE6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stk38lQ7TSE6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stk38lQ7TSE6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stk38lQ7TSE6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stk38lQ7TSE6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stk38lQ7TSE6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stk38lQ7TSE6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stk38lQ7TSE6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stk38lQ7TSE6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stk38lQ7TSE6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stk38lQ7TSE6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stk38lQ7TSE6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stk38lQ7TSE6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stk38lQ7TSE6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stk38lQ7TSE6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stk38lQ7TSE6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stk38lQ7TSE6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stk38lQ7TSE6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stk38lQ7TSE6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stk38lQ7TSE6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stk38lQ7TSE6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stk38lQ7TSE6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stk38lQ7TSE6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stk38lQ7TSE6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stk38lQ7TSE6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stk38lQ7TSE6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stk38lQ7TSE6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stk38lQ7TSE6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stk38lQ7TSE6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stk38lQ7TSE6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Stk38lQ7TSE6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stk38lQ7TSE6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Stk38lQ7TSE6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stk38lQ7TSE6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stk38lQ7TSE6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stk38lQ7TSE6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Stk38lQ7TSE6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stk38lQ7TSE6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stk38lQ7TSE6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stk38lQ7TSE6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stk38lQ7TSE6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stk38lQ7TSE6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stk38lQ7TSE6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stk38lQ7TSE6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stk38lQ7TSE6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stk38lQ7TSE6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stk38lQ7TSE6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stk38lQ7TSE6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stk38lQ7TSE6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stk38lQ7TSE6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stk38lQ7TSE6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stk38lQ7TSE6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stk38lQ7TSE6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stk38lQ7TSE6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stk38lQ7TSE6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stk38lQ7TSE6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stk38lQ7TSE6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stk38lQ7TSE6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stk38lQ7TSE6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Stk38lQ7TSE6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stk38lQ7TSE6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stk38lQ7TSE6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stk38lQ7TSE6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stk38lQ7TSE6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stk38lQ7TSE6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stk38lQ7TSE6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stk38lQ7TSE6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Stk38lQ7TSE6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stk38lQ7TSE6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stk38lQ7TSE6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stk38lQ7TSE6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stk38lQ7TSE6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stk38lQ7TSE6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stk38lQ7TSE6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stk38lQ7TSE6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stk38lQ7TSE6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stk38lQ7TSE6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stk38lQ7TSE6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stk38lQ7TSE6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stk38lQ7TSE6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms