Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU7

Letm2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letm2Q7TNU7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Letm2Q7TNU7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Letm2Q7TNU7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Letm2Q7TNU7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Letm2Q7TNU7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Letm2Q7TNU7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Letm2Q7TNU7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Letm2Q7TNU7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Letm2Q7TNU7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Letm2Q7TNU7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Letm2Q7TNU7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Letm2Q7TNU7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Letm2Q7TNU7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Letm2Q7TNU7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Letm2Q7TNU7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Letm2Q7TNU7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Letm2Q7TNU7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Letm2Q7TNU7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Letm2Q7TNU7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Letm2Q7TNU7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Letm2Q7TNU7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Letm2Q7TNU7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Letm2Q7TNU7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Letm2Q7TNU7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Letm2Q7TNU7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Letm2Q7TNU7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Letm2Q7TNU7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Letm2Q7TNU7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Letm2Q7TNU7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Letm2Q7TNU7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Letm2Q7TNU7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Letm2Q7TNU7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Letm2Q7TNU7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Letm2Q7TNU7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Letm2Q7TNU7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Letm2Q7TNU7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Letm2Q7TNU7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Letm2Q7TNU7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Letm2Q7TNU7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Letm2Q7TNU7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Letm2Q7TNU7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Letm2Q7TNU7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Letm2Q7TNU7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Letm2Q7TNU7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Letm2Q7TNU7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Letm2Q7TNU7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Letm2Q7TNU7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Letm2Q7TNU7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Letm2Q7TNU7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Letm2Q7TNU7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Letm2Q7TNU7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Letm2Q7TNU7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Letm2Q7TNU7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Letm2Q7TNU7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Letm2Q7TNU7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Letm2Q7TNU7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Letm2Q7TNU7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Letm2Q7TNU7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Letm2Q7TNU7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Letm2Q7TNU7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Letm2Q7TNU7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Letm2Q7TNU7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Letm2Q7TNU7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Letm2Q7TNU7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Letm2Q7TNU7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Letm2Q7TNU7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Letm2Q7TNU7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Letm2Q7TNU7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Letm2Q7TNU7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Letm2Q7TNU7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Letm2Q7TNU7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Letm2Q7TNU7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Letm2Q7TNU7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Letm2Q7TNU7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Letm2Q7TNU7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Letm2Q7TNU7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Letm2Q7TNU7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Letm2Q7TNU7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Letm2Q7TNU7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Letm2Q7TNU7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Letm2Q7TNU7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Letm2Q7TNU7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Letm2Q7TNU7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Letm2Q7TNU7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Letm2Q7TNU7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Letm2Q7TNU7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Letm2Q7TNU7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Letm2Q7TNU7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Letm2Q7TNU7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Letm2Q7TNU7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Letm2Q7TNU7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Letm2Q7TNU7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Letm2Q7TNU7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Letm2Q7TNU7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Letm2Q7TNU7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Letm2Q7TNU7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Letm2Q7TNU7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Letm2Q7TNU7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Letm2Q7TNU7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Letm2Q7TNU7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms