Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uhrf2Q7TMI3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uhrf2Q7TMI3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uhrf2Q7TMI3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uhrf2Q7TMI3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uhrf2Q7TMI3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uhrf2Q7TMI3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uhrf2Q7TMI3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uhrf2Q7TMI3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uhrf2Q7TMI3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uhrf2Q7TMI3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uhrf2Q7TMI3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uhrf2Q7TMI3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uhrf2Q7TMI3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uhrf2Q7TMI3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uhrf2Q7TMI3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uhrf2Q7TMI3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Uhrf2Q7TMI3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uhrf2Q7TMI3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uhrf2Q7TMI3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf2Q7TMI3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf2Q7TMI3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uhrf2Q7TMI3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uhrf2Q7TMI3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Uhrf2Q7TMI3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf2Q7TMI3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uhrf2Q7TMI3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uhrf2Q7TMI3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uhrf2Q7TMI3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uhrf2Q7TMI3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uhrf2Q7TMI3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uhrf2Q7TMI3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uhrf2Q7TMI3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Uhrf2Q7TMI3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uhrf2Q7TMI3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uhrf2Q7TMI3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uhrf2Q7TMI3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uhrf2Q7TMI3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uhrf2Q7TMI3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uhrf2Q7TMI3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uhrf2Q7TMI3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Uhrf2Q7TMI3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Uhrf2Q7TMI3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uhrf2Q7TMI3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Uhrf2Q7TMI3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uhrf2Q7TMI3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uhrf2Q7TMI3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uhrf2Q7TMI3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uhrf2Q7TMI3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uhrf2Q7TMI3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uhrf2Q7TMI3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Uhrf2Q7TMI3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uhrf2Q7TMI3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uhrf2Q7TMI3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uhrf2Q7TMI3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uhrf2Q7TMI3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uhrf2Q7TMI3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uhrf2Q7TMI3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uhrf2Q7TMI3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uhrf2Q7TMI3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Uhrf2Q7TMI3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Uhrf2Q7TMI3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uhrf2Q7TMI3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uhrf2Q7TMI3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Uhrf2Q7TMI3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uhrf2Q7TMI3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uhrf2Q7TMI3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uhrf2Q7TMI3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uhrf2Q7TMI3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uhrf2Q7TMI3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Uhrf2Q7TMI3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uhrf2Q7TMI3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Uhrf2Q7TMI3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf2Q7TMI3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf2Q7TMI3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf2Q7TMI3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf2Q7TMI3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf2Q7TMI3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf2Q7TMI3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf2Q7TMI3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf2Q7TMI3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf2Q7TMI3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf2Q7TMI3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf2Q7TMI3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uhrf2Q7TMI3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uhrf2Q7TMI3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uhrf2Q7TMI3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uhrf2Q7TMI3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uhrf2Q7TMI3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uhrf2Q7TMI3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Uhrf2Q7TMI3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uhrf2Q7TMI3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uhrf2Q7TMI3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uhrf2Q7TMI3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uhrf2Q7TMI3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Uhrf2Q7TMI3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Uhrf2Q7TMI3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Uhrf2Q7TMI3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Uhrf2Q7TMI3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Uhrf2Q7TMI3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms