Protein–RNA interactions for Protein: Q7M732

Rtl1, Retrotransposon-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl1Q7M732 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC44.72■■■■■ 4.75
Rtl1Q7M732 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
Rtl1Q7M732 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
Rtl1Q7M732 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
Rtl1Q7M732 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC44.66■■■■■ 4.74
Rtl1Q7M732 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
Rtl1Q7M732 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.64■■■■■ 4.74
Rtl1Q7M732 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.64■■■■■ 4.74
Rtl1Q7M732 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC44.64■■■■■ 4.74
Rtl1Q7M732 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
Rtl1Q7M732 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.61■■■■■ 4.73
Rtl1Q7M732 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
Rtl1Q7M732 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
Rtl1Q7M732 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.61■■■■■ 4.73
Rtl1Q7M732 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
Rtl1Q7M732 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC44.59■■■■■ 4.73
Rtl1Q7M732 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
Rtl1Q7M732 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
Rtl1Q7M732 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.55■■■■■ 4.72
Rtl1Q7M732 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
Rtl1Q7M732 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
Rtl1Q7M732 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC44.52■■■■■ 4.72
Rtl1Q7M732 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
Rtl1Q7M732 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
Rtl1Q7M732 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC44.5■■■■■ 4.71
Rtl1Q7M732 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
Rtl1Q7M732 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC44.48■■■■■ 4.71
Rtl1Q7M732 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
Rtl1Q7M732 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC44.43■■■■■ 4.7
Rtl1Q7M732 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
Rtl1Q7M732 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
Rtl1Q7M732 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
Rtl1Q7M732 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
Rtl1Q7M732 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
Rtl1Q7M732 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC44.38■■■■■ 4.7
Rtl1Q7M732 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
Rtl1Q7M732 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
Rtl1Q7M732 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
Rtl1Q7M732 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
Rtl1Q7M732 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC44.32■■■■■ 4.69
Rtl1Q7M732 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
Rtl1Q7M732 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
Rtl1Q7M732 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC44.31■■■■■ 4.68
Rtl1Q7M732 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC44.31■■■■■ 4.68
Rtl1Q7M732 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC44.31■■■■■ 4.68
Rtl1Q7M732 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
Rtl1Q7M732 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
Rtl1Q7M732 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC44.3■■■■■ 4.68
Rtl1Q7M732 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC44.29■■■■■ 4.68
Rtl1Q7M732 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
Rtl1Q7M732 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC44.28■■■■■ 4.68
Rtl1Q7M732 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
Rtl1Q7M732 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
Rtl1Q7M732 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Rtl1Q7M732 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Rtl1Q7M732 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
Rtl1Q7M732 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
Rtl1Q7M732 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC44.23■■■■■ 4.67
Rtl1Q7M732 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC44.22■■■■■ 4.67
Rtl1Q7M732 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
Rtl1Q7M732 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
Rtl1Q7M732 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC44.2■■■■■ 4.67
Rtl1Q7M732 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.2■■■■■ 4.67
Rtl1Q7M732 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC44.19■■■■■ 4.67
Rtl1Q7M732 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
Rtl1Q7M732 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
Rtl1Q7M732 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
Rtl1Q7M732 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
Rtl1Q7M732 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
Rtl1Q7M732 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
Rtl1Q7M732 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC44.13■■■■■ 4.65
Rtl1Q7M732 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
Rtl1Q7M732 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
Rtl1Q7M732 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.11■■■■■ 4.65
Rtl1Q7M732 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
Rtl1Q7M732 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
Rtl1Q7M732 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
Rtl1Q7M732 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
Rtl1Q7M732 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
Rtl1Q7M732 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC44.09■■■■■ 4.65
Rtl1Q7M732 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
Rtl1Q7M732 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
Rtl1Q7M732 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
Rtl1Q7M732 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.64
Rtl1Q7M732 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
Rtl1Q7M732 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
Rtl1Q7M732 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC44.05■■■■■ 4.64
Rtl1Q7M732 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
Rtl1Q7M732 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
Rtl1Q7M732 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.04■■■■■ 4.64
Rtl1Q7M732 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Rtl1Q7M732 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.99■■■■■ 4.63
Rtl1Q7M732 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
Rtl1Q7M732 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC43.96■■■■■ 4.63
Rtl1Q7M732 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
Rtl1Q7M732 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
Rtl1Q7M732 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
Rtl1Q7M732 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
Rtl1Q7M732 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
Rtl1Q7M732 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms