Protein–RNA interactions for Protein: Q78KK3

Slc22a18, Solute carrier family 22 member 18, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a18Q78KK3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc22a18Q78KK3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc22a18Q78KK3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc22a18Q78KK3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc22a18Q78KK3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc22a18Q78KK3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc22a18Q78KK3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc22a18Q78KK3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc22a18Q78KK3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc22a18Q78KK3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc22a18Q78KK3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc22a18Q78KK3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc22a18Q78KK3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc22a18Q78KK3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc22a18Q78KK3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc22a18Q78KK3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc22a18Q78KK3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc22a18Q78KK3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc22a18Q78KK3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc22a18Q78KK3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc22a18Q78KK3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc22a18Q78KK3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc22a18Q78KK3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc22a18Q78KK3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc22a18Q78KK3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc22a18Q78KK3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Slc22a18Q78KK3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Slc22a18Q78KK3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Slc22a18Q78KK3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc22a18Q78KK3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc22a18Q78KK3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc22a18Q78KK3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc22a18Q78KK3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc22a18Q78KK3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc22a18Q78KK3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc22a18Q78KK3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc22a18Q78KK3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc22a18Q78KK3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc22a18Q78KK3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc22a18Q78KK3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc22a18Q78KK3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc22a18Q78KK3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc22a18Q78KK3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc22a18Q78KK3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc22a18Q78KK3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc22a18Q78KK3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc22a18Q78KK3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc22a18Q78KK3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc22a18Q78KK3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc22a18Q78KK3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc22a18Q78KK3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc22a18Q78KK3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc22a18Q78KK3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc22a18Q78KK3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc22a18Q78KK3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc22a18Q78KK3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc22a18Q78KK3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc22a18Q78KK3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc22a18Q78KK3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc22a18Q78KK3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc22a18Q78KK3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc22a18Q78KK3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc22a18Q78KK3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc22a18Q78KK3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc22a18Q78KK3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc22a18Q78KK3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc22a18Q78KK3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc22a18Q78KK3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc22a18Q78KK3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc22a18Q78KK3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc22a18Q78KK3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc22a18Q78KK3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc22a18Q78KK3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc22a18Q78KK3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc22a18Q78KK3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc22a18Q78KK3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc22a18Q78KK3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc22a18Q78KK3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc22a18Q78KK3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc22a18Q78KK3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc22a18Q78KK3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc22a18Q78KK3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc22a18Q78KK3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc22a18Q78KK3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc22a18Q78KK3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc22a18Q78KK3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc22a18Q78KK3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc22a18Q78KK3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc22a18Q78KK3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc22a18Q78KK3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc22a18Q78KK3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc22a18Q78KK3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc22a18Q78KK3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc22a18Q78KK3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc22a18Q78KK3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc22a18Q78KK3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc22a18Q78KK3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc22a18Q78KK3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc22a18Q78KK3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc22a18Q78KK3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms