Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smpd4Q6ZPR5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smpd4Q6ZPR5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smpd4Q6ZPR5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smpd4Q6ZPR5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smpd4Q6ZPR5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smpd4Q6ZPR5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smpd4Q6ZPR5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smpd4Q6ZPR5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smpd4Q6ZPR5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smpd4Q6ZPR5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smpd4Q6ZPR5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smpd4Q6ZPR5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smpd4Q6ZPR5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Smpd4Q6ZPR5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smpd4Q6ZPR5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smpd4Q6ZPR5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smpd4Q6ZPR5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smpd4Q6ZPR5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Smpd4Q6ZPR5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smpd4Q6ZPR5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smpd4Q6ZPR5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smpd4Q6ZPR5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smpd4Q6ZPR5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smpd4Q6ZPR5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smpd4Q6ZPR5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smpd4Q6ZPR5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smpd4Q6ZPR5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smpd4Q6ZPR5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smpd4Q6ZPR5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smpd4Q6ZPR5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smpd4Q6ZPR5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smpd4Q6ZPR5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smpd4Q6ZPR5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smpd4Q6ZPR5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smpd4Q6ZPR5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Smpd4Q6ZPR5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Smpd4Q6ZPR5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smpd4Q6ZPR5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smpd4Q6ZPR5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smpd4Q6ZPR5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smpd4Q6ZPR5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smpd4Q6ZPR5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smpd4Q6ZPR5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smpd4Q6ZPR5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smpd4Q6ZPR5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smpd4Q6ZPR5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smpd4Q6ZPR5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smpd4Q6ZPR5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smpd4Q6ZPR5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smpd4Q6ZPR5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smpd4Q6ZPR5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Smpd4Q6ZPR5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smpd4Q6ZPR5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smpd4Q6ZPR5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smpd4Q6ZPR5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smpd4Q6ZPR5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smpd4Q6ZPR5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smpd4Q6ZPR5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smpd4Q6ZPR5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smpd4Q6ZPR5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smpd4Q6ZPR5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smpd4Q6ZPR5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smpd4Q6ZPR5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Smpd4Q6ZPR5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Smpd4Q6ZPR5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smpd4Q6ZPR5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smpd4Q6ZPR5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Smpd4Q6ZPR5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smpd4Q6ZPR5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smpd4Q6ZPR5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smpd4Q6ZPR5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smpd4Q6ZPR5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smpd4Q6ZPR5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smpd4Q6ZPR5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smpd4Q6ZPR5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smpd4Q6ZPR5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smpd4Q6ZPR5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smpd4Q6ZPR5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smpd4Q6ZPR5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smpd4Q6ZPR5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smpd4Q6ZPR5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smpd4Q6ZPR5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smpd4Q6ZPR5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Smpd4Q6ZPR5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smpd4Q6ZPR5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smpd4Q6ZPR5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smpd4Q6ZPR5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smpd4Q6ZPR5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smpd4Q6ZPR5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smpd4Q6ZPR5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smpd4Q6ZPR5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smpd4Q6ZPR5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smpd4Q6ZPR5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smpd4Q6ZPR5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smpd4Q6ZPR5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smpd4Q6ZPR5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smpd4Q6ZPR5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smpd4Q6ZPR5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smpd4Q6ZPR5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms