Protein–RNA interactions for Protein: Q6VYH9

Hsh2d, Hematopoietic SH2 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsh2dQ6VYH9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hsh2dQ6VYH9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hsh2dQ6VYH9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hsh2dQ6VYH9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hsh2dQ6VYH9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hsh2dQ6VYH9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hsh2dQ6VYH9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hsh2dQ6VYH9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hsh2dQ6VYH9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hsh2dQ6VYH9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hsh2dQ6VYH9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hsh2dQ6VYH9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hsh2dQ6VYH9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hsh2dQ6VYH9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hsh2dQ6VYH9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hsh2dQ6VYH9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hsh2dQ6VYH9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hsh2dQ6VYH9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hsh2dQ6VYH9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hsh2dQ6VYH9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hsh2dQ6VYH9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hsh2dQ6VYH9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hsh2dQ6VYH9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hsh2dQ6VYH9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hsh2dQ6VYH9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hsh2dQ6VYH9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hsh2dQ6VYH9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hsh2dQ6VYH9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hsh2dQ6VYH9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hsh2dQ6VYH9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hsh2dQ6VYH9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hsh2dQ6VYH9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hsh2dQ6VYH9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hsh2dQ6VYH9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hsh2dQ6VYH9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hsh2dQ6VYH9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hsh2dQ6VYH9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hsh2dQ6VYH9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hsh2dQ6VYH9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hsh2dQ6VYH9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hsh2dQ6VYH9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hsh2dQ6VYH9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hsh2dQ6VYH9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Hsh2dQ6VYH9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hsh2dQ6VYH9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hsh2dQ6VYH9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hsh2dQ6VYH9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hsh2dQ6VYH9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hsh2dQ6VYH9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hsh2dQ6VYH9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hsh2dQ6VYH9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hsh2dQ6VYH9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hsh2dQ6VYH9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hsh2dQ6VYH9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Hsh2dQ6VYH9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hsh2dQ6VYH9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hsh2dQ6VYH9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hsh2dQ6VYH9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hsh2dQ6VYH9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hsh2dQ6VYH9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hsh2dQ6VYH9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hsh2dQ6VYH9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hsh2dQ6VYH9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hsh2dQ6VYH9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hsh2dQ6VYH9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hsh2dQ6VYH9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hsh2dQ6VYH9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hsh2dQ6VYH9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hsh2dQ6VYH9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hsh2dQ6VYH9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hsh2dQ6VYH9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hsh2dQ6VYH9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hsh2dQ6VYH9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hsh2dQ6VYH9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hsh2dQ6VYH9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hsh2dQ6VYH9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hsh2dQ6VYH9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hsh2dQ6VYH9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hsh2dQ6VYH9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hsh2dQ6VYH9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hsh2dQ6VYH9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hsh2dQ6VYH9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hsh2dQ6VYH9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hsh2dQ6VYH9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hsh2dQ6VYH9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hsh2dQ6VYH9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hsh2dQ6VYH9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hsh2dQ6VYH9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hsh2dQ6VYH9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hsh2dQ6VYH9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hsh2dQ6VYH9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hsh2dQ6VYH9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hsh2dQ6VYH9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hsh2dQ6VYH9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hsh2dQ6VYH9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hsh2dQ6VYH9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hsh2dQ6VYH9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hsh2dQ6VYH9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hsh2dQ6VYH9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hsh2dQ6VYH9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms