Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atp8b3Q6UQ17 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atp8b3Q6UQ17 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atp8b3Q6UQ17 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atp8b3Q6UQ17 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Atp8b3Q6UQ17 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atp8b3Q6UQ17 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Atp8b3Q6UQ17 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Atp8b3Q6UQ17 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Atp8b3Q6UQ17 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atp8b3Q6UQ17 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atp8b3Q6UQ17 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atp8b3Q6UQ17 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atp8b3Q6UQ17 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atp8b3Q6UQ17 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atp8b3Q6UQ17 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Atp8b3Q6UQ17 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atp8b3Q6UQ17 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atp8b3Q6UQ17 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atp8b3Q6UQ17 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atp8b3Q6UQ17 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atp8b3Q6UQ17 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atp8b3Q6UQ17 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atp8b3Q6UQ17 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atp8b3Q6UQ17 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atp8b3Q6UQ17 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atp8b3Q6UQ17 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atp8b3Q6UQ17 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atp8b3Q6UQ17 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atp8b3Q6UQ17 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atp8b3Q6UQ17 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atp8b3Q6UQ17 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atp8b3Q6UQ17 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Atp8b3Q6UQ17 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atp8b3Q6UQ17 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atp8b3Q6UQ17 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Atp8b3Q6UQ17 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atp8b3Q6UQ17 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atp8b3Q6UQ17 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Atp8b3Q6UQ17 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atp8b3Q6UQ17 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atp8b3Q6UQ17 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atp8b3Q6UQ17 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atp8b3Q6UQ17 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Atp8b3Q6UQ17 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atp8b3Q6UQ17 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp8b3Q6UQ17 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp8b3Q6UQ17 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp8b3Q6UQ17 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp8b3Q6UQ17 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp8b3Q6UQ17 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atp8b3Q6UQ17 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atp8b3Q6UQ17 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atp8b3Q6UQ17 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atp8b3Q6UQ17 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atp8b3Q6UQ17 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atp8b3Q6UQ17 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Atp8b3Q6UQ17 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atp8b3Q6UQ17 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atp8b3Q6UQ17 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Atp8b3Q6UQ17 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Atp8b3Q6UQ17 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atp8b3Q6UQ17 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atp8b3Q6UQ17 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atp8b3Q6UQ17 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atp8b3Q6UQ17 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atp8b3Q6UQ17 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atp8b3Q6UQ17 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atp8b3Q6UQ17 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atp8b3Q6UQ17 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atp8b3Q6UQ17 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Atp8b3Q6UQ17 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atp8b3Q6UQ17 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atp8b3Q6UQ17 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atp8b3Q6UQ17 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atp8b3Q6UQ17 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atp8b3Q6UQ17 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atp8b3Q6UQ17 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Atp8b3Q6UQ17 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Atp8b3Q6UQ17 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atp8b3Q6UQ17 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atp8b3Q6UQ17 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atp8b3Q6UQ17 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atp8b3Q6UQ17 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atp8b3Q6UQ17 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atp8b3Q6UQ17 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atp8b3Q6UQ17 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atp8b3Q6UQ17 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atp8b3Q6UQ17 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atp8b3Q6UQ17 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Atp8b3Q6UQ17 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atp8b3Q6UQ17 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atp8b3Q6UQ17 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atp8b3Q6UQ17 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atp8b3Q6UQ17 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atp8b3Q6UQ17 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atp8b3Q6UQ17 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
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