Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIE5

Atp1a2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a2Q6PIE5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp1a2Q6PIE5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp1a2Q6PIE5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp1a2Q6PIE5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp1a2Q6PIE5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp1a2Q6PIE5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp1a2Q6PIE5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp1a2Q6PIE5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp1a2Q6PIE5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp1a2Q6PIE5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp1a2Q6PIE5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp1a2Q6PIE5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp1a2Q6PIE5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp1a2Q6PIE5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp1a2Q6PIE5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp1a2Q6PIE5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp1a2Q6PIE5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp1a2Q6PIE5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp1a2Q6PIE5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp1a2Q6PIE5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp1a2Q6PIE5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp1a2Q6PIE5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp1a2Q6PIE5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp1a2Q6PIE5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp1a2Q6PIE5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp1a2Q6PIE5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp1a2Q6PIE5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp1a2Q6PIE5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp1a2Q6PIE5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp1a2Q6PIE5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp1a2Q6PIE5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp1a2Q6PIE5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp1a2Q6PIE5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp1a2Q6PIE5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp1a2Q6PIE5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp1a2Q6PIE5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp1a2Q6PIE5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp1a2Q6PIE5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp1a2Q6PIE5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp1a2Q6PIE5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp1a2Q6PIE5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp1a2Q6PIE5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp1a2Q6PIE5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp1a2Q6PIE5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp1a2Q6PIE5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp1a2Q6PIE5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp1a2Q6PIE5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp1a2Q6PIE5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp1a2Q6PIE5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp1a2Q6PIE5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp1a2Q6PIE5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp1a2Q6PIE5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp1a2Q6PIE5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp1a2Q6PIE5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp1a2Q6PIE5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp1a2Q6PIE5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp1a2Q6PIE5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp1a2Q6PIE5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1a2Q6PIE5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1a2Q6PIE5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1a2Q6PIE5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1a2Q6PIE5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1a2Q6PIE5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1a2Q6PIE5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp1a2Q6PIE5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp1a2Q6PIE5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp1a2Q6PIE5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp1a2Q6PIE5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp1a2Q6PIE5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp1a2Q6PIE5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp1a2Q6PIE5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp1a2Q6PIE5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp1a2Q6PIE5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp1a2Q6PIE5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp1a2Q6PIE5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp1a2Q6PIE5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp1a2Q6PIE5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp1a2Q6PIE5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp1a2Q6PIE5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp1a2Q6PIE5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Atp1a2Q6PIE5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp1a2Q6PIE5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp1a2Q6PIE5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp1a2Q6PIE5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp1a2Q6PIE5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp1a2Q6PIE5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp1a2Q6PIE5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp1a2Q6PIE5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp1a2Q6PIE5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp1a2Q6PIE5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp1a2Q6PIE5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp1a2Q6PIE5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1a2Q6PIE5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1a2Q6PIE5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1a2Q6PIE5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp1a2Q6PIE5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp1a2Q6PIE5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp1a2Q6PIE5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp1a2Q6PIE5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp1a2Q6PIE5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms