Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHQ9

Pabpc4, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4Q6PHQ9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pabpc4Q6PHQ9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pabpc4Q6PHQ9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pabpc4Q6PHQ9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pabpc4Q6PHQ9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pabpc4Q6PHQ9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pabpc4Q6PHQ9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pabpc4Q6PHQ9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pabpc4Q6PHQ9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pabpc4Q6PHQ9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pabpc4Q6PHQ9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pabpc4Q6PHQ9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pabpc4Q6PHQ9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pabpc4Q6PHQ9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pabpc4Q6PHQ9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pabpc4Q6PHQ9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pabpc4Q6PHQ9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pabpc4Q6PHQ9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Pabpc4Q6PHQ9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Pabpc4Q6PHQ9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pabpc4Q6PHQ9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pabpc4Q6PHQ9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pabpc4Q6PHQ9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pabpc4Q6PHQ9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pabpc4Q6PHQ9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Pabpc4Q6PHQ9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pabpc4Q6PHQ9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pabpc4Q6PHQ9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pabpc4Q6PHQ9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pabpc4Q6PHQ9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Pabpc4Q6PHQ9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Pabpc4Q6PHQ9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pabpc4Q6PHQ9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pabpc4Q6PHQ9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pabpc4Q6PHQ9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pabpc4Q6PHQ9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pabpc4Q6PHQ9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pabpc4Q6PHQ9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pabpc4Q6PHQ9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pabpc4Q6PHQ9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pabpc4Q6PHQ9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pabpc4Q6PHQ9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pabpc4Q6PHQ9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pabpc4Q6PHQ9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pabpc4Q6PHQ9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pabpc4Q6PHQ9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pabpc4Q6PHQ9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Pabpc4Q6PHQ9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pabpc4Q6PHQ9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pabpc4Q6PHQ9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pabpc4Q6PHQ9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pabpc4Q6PHQ9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pabpc4Q6PHQ9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pabpc4Q6PHQ9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pabpc4Q6PHQ9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pabpc4Q6PHQ9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pabpc4Q6PHQ9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pabpc4Q6PHQ9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pabpc4Q6PHQ9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pabpc4Q6PHQ9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pabpc4Q6PHQ9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Pabpc4Q6PHQ9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pabpc4Q6PHQ9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pabpc4Q6PHQ9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pabpc4Q6PHQ9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pabpc4Q6PHQ9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pabpc4Q6PHQ9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pabpc4Q6PHQ9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pabpc4Q6PHQ9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pabpc4Q6PHQ9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pabpc4Q6PHQ9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pabpc4Q6PHQ9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pabpc4Q6PHQ9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pabpc4Q6PHQ9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pabpc4Q6PHQ9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pabpc4Q6PHQ9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pabpc4Q6PHQ9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pabpc4Q6PHQ9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pabpc4Q6PHQ9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Pabpc4Q6PHQ9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pabpc4Q6PHQ9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pabpc4Q6PHQ9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pabpc4Q6PHQ9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pabpc4Q6PHQ9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pabpc4Q6PHQ9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pabpc4Q6PHQ9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pabpc4Q6PHQ9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pabpc4Q6PHQ9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pabpc4Q6PHQ9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Pabpc4Q6PHQ9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pabpc4Q6PHQ9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pabpc4Q6PHQ9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pabpc4Q6PHQ9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pabpc4Q6PHQ9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pabpc4Q6PHQ9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pabpc4Q6PHQ9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pabpc4Q6PHQ9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pabpc4Q6PHQ9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pabpc4Q6PHQ9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pabpc4Q6PHQ9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms