Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFQ7

Rasa4, Ras GTPase-activating protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa4Q6PFQ7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rasa4Q6PFQ7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rasa4Q6PFQ7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rasa4Q6PFQ7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rasa4Q6PFQ7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rasa4Q6PFQ7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rasa4Q6PFQ7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rasa4Q6PFQ7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Rasa4Q6PFQ7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rasa4Q6PFQ7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rasa4Q6PFQ7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rasa4Q6PFQ7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rasa4Q6PFQ7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rasa4Q6PFQ7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rasa4Q6PFQ7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rasa4Q6PFQ7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rasa4Q6PFQ7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Rasa4Q6PFQ7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rasa4Q6PFQ7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rasa4Q6PFQ7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rasa4Q6PFQ7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rasa4Q6PFQ7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rasa4Q6PFQ7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rasa4Q6PFQ7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rasa4Q6PFQ7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rasa4Q6PFQ7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rasa4Q6PFQ7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rasa4Q6PFQ7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rasa4Q6PFQ7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rasa4Q6PFQ7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rasa4Q6PFQ7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rasa4Q6PFQ7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rasa4Q6PFQ7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rasa4Q6PFQ7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rasa4Q6PFQ7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rasa4Q6PFQ7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rasa4Q6PFQ7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rasa4Q6PFQ7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rasa4Q6PFQ7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rasa4Q6PFQ7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rasa4Q6PFQ7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rasa4Q6PFQ7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rasa4Q6PFQ7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rasa4Q6PFQ7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rasa4Q6PFQ7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rasa4Q6PFQ7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rasa4Q6PFQ7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rasa4Q6PFQ7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rasa4Q6PFQ7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rasa4Q6PFQ7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rasa4Q6PFQ7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rasa4Q6PFQ7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rasa4Q6PFQ7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rasa4Q6PFQ7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rasa4Q6PFQ7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rasa4Q6PFQ7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rasa4Q6PFQ7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rasa4Q6PFQ7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rasa4Q6PFQ7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rasa4Q6PFQ7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rasa4Q6PFQ7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rasa4Q6PFQ7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rasa4Q6PFQ7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rasa4Q6PFQ7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rasa4Q6PFQ7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rasa4Q6PFQ7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rasa4Q6PFQ7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rasa4Q6PFQ7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rasa4Q6PFQ7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rasa4Q6PFQ7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rasa4Q6PFQ7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rasa4Q6PFQ7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rasa4Q6PFQ7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rasa4Q6PFQ7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rasa4Q6PFQ7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rasa4Q6PFQ7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rasa4Q6PFQ7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rasa4Q6PFQ7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rasa4Q6PFQ7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rasa4Q6PFQ7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rasa4Q6PFQ7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rasa4Q6PFQ7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rasa4Q6PFQ7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rasa4Q6PFQ7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rasa4Q6PFQ7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rasa4Q6PFQ7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rasa4Q6PFQ7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rasa4Q6PFQ7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rasa4Q6PFQ7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rasa4Q6PFQ7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rasa4Q6PFQ7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rasa4Q6PFQ7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rasa4Q6PFQ7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rasa4Q6PFQ7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rasa4Q6PFQ7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rasa4Q6PFQ7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rasa4Q6PFQ7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rasa4Q6PFQ7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rasa4Q6PFQ7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rasa4Q6PFQ7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.8 ms