Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S0

Mtss1l, MTSS1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtss1lQ6P9S0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mtss1lQ6P9S0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mtss1lQ6P9S0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mtss1lQ6P9S0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mtss1lQ6P9S0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mtss1lQ6P9S0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mtss1lQ6P9S0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mtss1lQ6P9S0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mtss1lQ6P9S0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Mtss1lQ6P9S0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mtss1lQ6P9S0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mtss1lQ6P9S0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mtss1lQ6P9S0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mtss1lQ6P9S0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mtss1lQ6P9S0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mtss1lQ6P9S0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mtss1lQ6P9S0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mtss1lQ6P9S0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Mtss1lQ6P9S0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Mtss1lQ6P9S0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Mtss1lQ6P9S0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mtss1lQ6P9S0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mtss1lQ6P9S0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mtss1lQ6P9S0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mtss1lQ6P9S0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mtss1lQ6P9S0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mtss1lQ6P9S0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mtss1lQ6P9S0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Mtss1lQ6P9S0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Mtss1lQ6P9S0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Mtss1lQ6P9S0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mtss1lQ6P9S0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mtss1lQ6P9S0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Mtss1lQ6P9S0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mtss1lQ6P9S0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mtss1lQ6P9S0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mtss1lQ6P9S0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mtss1lQ6P9S0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Mtss1lQ6P9S0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mtss1lQ6P9S0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mtss1lQ6P9S0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mtss1lQ6P9S0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Mtss1lQ6P9S0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mtss1lQ6P9S0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mtss1lQ6P9S0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mtss1lQ6P9S0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mtss1lQ6P9S0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mtss1lQ6P9S0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mtss1lQ6P9S0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mtss1lQ6P9S0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mtss1lQ6P9S0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mtss1lQ6P9S0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mtss1lQ6P9S0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mtss1lQ6P9S0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Mtss1lQ6P9S0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mtss1lQ6P9S0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mtss1lQ6P9S0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mtss1lQ6P9S0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mtss1lQ6P9S0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mtss1lQ6P9S0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mtss1lQ6P9S0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mtss1lQ6P9S0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mtss1lQ6P9S0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Mtss1lQ6P9S0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Mtss1lQ6P9S0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mtss1lQ6P9S0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mtss1lQ6P9S0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mtss1lQ6P9S0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mtss1lQ6P9S0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mtss1lQ6P9S0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mtss1lQ6P9S0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mtss1lQ6P9S0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mtss1lQ6P9S0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mtss1lQ6P9S0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mtss1lQ6P9S0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mtss1lQ6P9S0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mtss1lQ6P9S0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mtss1lQ6P9S0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mtss1lQ6P9S0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mtss1lQ6P9S0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mtss1lQ6P9S0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mtss1lQ6P9S0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mtss1lQ6P9S0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mtss1lQ6P9S0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mtss1lQ6P9S0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mtss1lQ6P9S0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mtss1lQ6P9S0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mtss1lQ6P9S0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mtss1lQ6P9S0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mtss1lQ6P9S0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mtss1lQ6P9S0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mtss1lQ6P9S0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mtss1lQ6P9S0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mtss1lQ6P9S0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Mtss1lQ6P9S0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Mtss1lQ6P9S0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mtss1lQ6P9S0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mtss1lQ6P9S0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mtss1lQ6P9S0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mtss1lQ6P9S0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms