Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8Y7

Snx31, Sorting nexin-31, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx31Q6P8Y7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx31Q6P8Y7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx31Q6P8Y7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx31Q6P8Y7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx31Q6P8Y7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx31Q6P8Y7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx31Q6P8Y7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx31Q6P8Y7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx31Q6P8Y7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx31Q6P8Y7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx31Q6P8Y7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx31Q6P8Y7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx31Q6P8Y7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx31Q6P8Y7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx31Q6P8Y7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx31Q6P8Y7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx31Q6P8Y7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx31Q6P8Y7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx31Q6P8Y7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx31Q6P8Y7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx31Q6P8Y7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx31Q6P8Y7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx31Q6P8Y7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx31Q6P8Y7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx31Q6P8Y7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx31Q6P8Y7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx31Q6P8Y7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx31Q6P8Y7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx31Q6P8Y7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx31Q6P8Y7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx31Q6P8Y7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx31Q6P8Y7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx31Q6P8Y7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx31Q6P8Y7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx31Q6P8Y7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx31Q6P8Y7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx31Q6P8Y7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx31Q6P8Y7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx31Q6P8Y7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx31Q6P8Y7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx31Q6P8Y7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snx31Q6P8Y7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx31Q6P8Y7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx31Q6P8Y7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx31Q6P8Y7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx31Q6P8Y7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx31Q6P8Y7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx31Q6P8Y7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx31Q6P8Y7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx31Q6P8Y7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx31Q6P8Y7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx31Q6P8Y7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx31Q6P8Y7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx31Q6P8Y7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx31Q6P8Y7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx31Q6P8Y7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx31Q6P8Y7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx31Q6P8Y7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx31Q6P8Y7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx31Q6P8Y7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx31Q6P8Y7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx31Q6P8Y7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx31Q6P8Y7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx31Q6P8Y7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx31Q6P8Y7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx31Q6P8Y7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx31Q6P8Y7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx31Q6P8Y7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx31Q6P8Y7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx31Q6P8Y7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx31Q6P8Y7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx31Q6P8Y7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx31Q6P8Y7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx31Q6P8Y7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx31Q6P8Y7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx31Q6P8Y7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx31Q6P8Y7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx31Q6P8Y7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx31Q6P8Y7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx31Q6P8Y7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx31Q6P8Y7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx31Q6P8Y7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx31Q6P8Y7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx31Q6P8Y7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx31Q6P8Y7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx31Q6P8Y7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Snx31Q6P8Y7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Snx31Q6P8Y7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx31Q6P8Y7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx31Q6P8Y7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx31Q6P8Y7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx31Q6P8Y7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx31Q6P8Y7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx31Q6P8Y7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx31Q6P8Y7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx31Q6P8Y7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx31Q6P8Y7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx31Q6P8Y7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx31Q6P8Y7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx31Q6P8Y7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms