Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Podnl1Q6P3Y9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Podnl1Q6P3Y9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Podnl1Q6P3Y9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Podnl1Q6P3Y9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Podnl1Q6P3Y9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Podnl1Q6P3Y9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Podnl1Q6P3Y9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Podnl1Q6P3Y9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Podnl1Q6P3Y9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Podnl1Q6P3Y9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Podnl1Q6P3Y9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Podnl1Q6P3Y9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Podnl1Q6P3Y9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Podnl1Q6P3Y9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Podnl1Q6P3Y9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Podnl1Q6P3Y9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Podnl1Q6P3Y9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Podnl1Q6P3Y9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Podnl1Q6P3Y9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Podnl1Q6P3Y9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Podnl1Q6P3Y9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Podnl1Q6P3Y9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Podnl1Q6P3Y9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Podnl1Q6P3Y9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Podnl1Q6P3Y9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Podnl1Q6P3Y9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Podnl1Q6P3Y9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Podnl1Q6P3Y9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Podnl1Q6P3Y9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Podnl1Q6P3Y9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Podnl1Q6P3Y9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Podnl1Q6P3Y9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Podnl1Q6P3Y9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Podnl1Q6P3Y9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Podnl1Q6P3Y9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Podnl1Q6P3Y9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Podnl1Q6P3Y9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Podnl1Q6P3Y9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Podnl1Q6P3Y9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Podnl1Q6P3Y9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Podnl1Q6P3Y9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Podnl1Q6P3Y9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Podnl1Q6P3Y9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Podnl1Q6P3Y9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Podnl1Q6P3Y9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Podnl1Q6P3Y9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Podnl1Q6P3Y9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Podnl1Q6P3Y9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Podnl1Q6P3Y9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Podnl1Q6P3Y9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Podnl1Q6P3Y9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Podnl1Q6P3Y9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Podnl1Q6P3Y9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Podnl1Q6P3Y9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Podnl1Q6P3Y9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Podnl1Q6P3Y9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Podnl1Q6P3Y9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Podnl1Q6P3Y9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Podnl1Q6P3Y9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Podnl1Q6P3Y9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Podnl1Q6P3Y9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Podnl1Q6P3Y9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Podnl1Q6P3Y9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Podnl1Q6P3Y9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Podnl1Q6P3Y9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Podnl1Q6P3Y9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Podnl1Q6P3Y9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Podnl1Q6P3Y9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Podnl1Q6P3Y9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Podnl1Q6P3Y9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Podnl1Q6P3Y9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Podnl1Q6P3Y9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Podnl1Q6P3Y9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Podnl1Q6P3Y9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Podnl1Q6P3Y9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Podnl1Q6P3Y9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Podnl1Q6P3Y9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Podnl1Q6P3Y9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Podnl1Q6P3Y9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Podnl1Q6P3Y9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms