Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Podnl1Q6P3Y9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Podnl1Q6P3Y9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Podnl1Q6P3Y9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Podnl1Q6P3Y9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Podnl1Q6P3Y9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Podnl1Q6P3Y9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Podnl1Q6P3Y9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Podnl1Q6P3Y9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Podnl1Q6P3Y9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Podnl1Q6P3Y9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Podnl1Q6P3Y9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Podnl1Q6P3Y9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Podnl1Q6P3Y9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Podnl1Q6P3Y9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Podnl1Q6P3Y9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Podnl1Q6P3Y9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Podnl1Q6P3Y9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Podnl1Q6P3Y9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Podnl1Q6P3Y9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Podnl1Q6P3Y9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Podnl1Q6P3Y9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Podnl1Q6P3Y9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Podnl1Q6P3Y9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Podnl1Q6P3Y9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Podnl1Q6P3Y9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Podnl1Q6P3Y9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Podnl1Q6P3Y9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Podnl1Q6P3Y9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Podnl1Q6P3Y9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Podnl1Q6P3Y9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Podnl1Q6P3Y9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Podnl1Q6P3Y9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Podnl1Q6P3Y9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Podnl1Q6P3Y9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Podnl1Q6P3Y9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Podnl1Q6P3Y9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Podnl1Q6P3Y9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Podnl1Q6P3Y9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Podnl1Q6P3Y9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Podnl1Q6P3Y9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Podnl1Q6P3Y9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Podnl1Q6P3Y9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Podnl1Q6P3Y9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Podnl1Q6P3Y9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Podnl1Q6P3Y9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Podnl1Q6P3Y9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Podnl1Q6P3Y9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Podnl1Q6P3Y9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Podnl1Q6P3Y9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Podnl1Q6P3Y9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Podnl1Q6P3Y9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Podnl1Q6P3Y9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Podnl1Q6P3Y9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Podnl1Q6P3Y9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Podnl1Q6P3Y9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Podnl1Q6P3Y9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Podnl1Q6P3Y9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Podnl1Q6P3Y9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Podnl1Q6P3Y9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Podnl1Q6P3Y9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Podnl1Q6P3Y9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Podnl1Q6P3Y9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Podnl1Q6P3Y9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Podnl1Q6P3Y9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Podnl1Q6P3Y9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Podnl1Q6P3Y9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Podnl1Q6P3Y9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Podnl1Q6P3Y9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Podnl1Q6P3Y9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Podnl1Q6P3Y9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Podnl1Q6P3Y9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Podnl1Q6P3Y9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Podnl1Q6P3Y9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Podnl1Q6P3Y9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Podnl1Q6P3Y9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Podnl1Q6P3Y9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Podnl1Q6P3Y9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Podnl1Q6P3Y9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Podnl1Q6P3Y9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Podnl1Q6P3Y9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Podnl1Q6P3Y9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms