Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Colgalt2Q6NVG7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Colgalt2Q6NVG7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Colgalt2Q6NVG7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Colgalt2Q6NVG7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Colgalt2Q6NVG7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Colgalt2Q6NVG7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Colgalt2Q6NVG7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Colgalt2Q6NVG7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Colgalt2Q6NVG7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Colgalt2Q6NVG7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Colgalt2Q6NVG7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Colgalt2Q6NVG7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Colgalt2Q6NVG7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Colgalt2Q6NVG7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Colgalt2Q6NVG7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Colgalt2Q6NVG7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Colgalt2Q6NVG7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Colgalt2Q6NVG7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Colgalt2Q6NVG7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Colgalt2Q6NVG7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Colgalt2Q6NVG7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Colgalt2Q6NVG7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Colgalt2Q6NVG7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Colgalt2Q6NVG7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Colgalt2Q6NVG7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Colgalt2Q6NVG7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Colgalt2Q6NVG7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Colgalt2Q6NVG7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Colgalt2Q6NVG7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Colgalt2Q6NVG7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Colgalt2Q6NVG7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Colgalt2Q6NVG7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Colgalt2Q6NVG7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Colgalt2Q6NVG7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Colgalt2Q6NVG7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Colgalt2Q6NVG7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Colgalt2Q6NVG7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Colgalt2Q6NVG7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Colgalt2Q6NVG7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Colgalt2Q6NVG7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Colgalt2Q6NVG7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Colgalt2Q6NVG7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Colgalt2Q6NVG7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Colgalt2Q6NVG7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Colgalt2Q6NVG7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Colgalt2Q6NVG7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Colgalt2Q6NVG7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Colgalt2Q6NVG7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Colgalt2Q6NVG7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Colgalt2Q6NVG7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Colgalt2Q6NVG7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Colgalt2Q6NVG7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Colgalt2Q6NVG7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Colgalt2Q6NVG7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Colgalt2Q6NVG7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Colgalt2Q6NVG7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Colgalt2Q6NVG7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Colgalt2Q6NVG7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Colgalt2Q6NVG7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Colgalt2Q6NVG7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Colgalt2Q6NVG7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Colgalt2Q6NVG7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Colgalt2Q6NVG7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Colgalt2Q6NVG7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Colgalt2Q6NVG7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Colgalt2Q6NVG7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Colgalt2Q6NVG7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Colgalt2Q6NVG7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Colgalt2Q6NVG7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Colgalt2Q6NVG7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Colgalt2Q6NVG7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Colgalt2Q6NVG7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Colgalt2Q6NVG7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Colgalt2Q6NVG7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Colgalt2Q6NVG7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Colgalt2Q6NVG7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Colgalt2Q6NVG7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Colgalt2Q6NVG7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Colgalt2Q6NVG7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Colgalt2Q6NVG7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Colgalt2Q6NVG7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Colgalt2Q6NVG7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Colgalt2Q6NVG7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Colgalt2Q6NVG7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Colgalt2Q6NVG7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Colgalt2Q6NVG7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Colgalt2Q6NVG7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Colgalt2Q6NVG7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Colgalt2Q6NVG7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Colgalt2Q6NVG7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Colgalt2Q6NVG7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Colgalt2Q6NVG7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Colgalt2Q6NVG7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Colgalt2Q6NVG7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Colgalt2Q6NVG7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Colgalt2Q6NVG7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Colgalt2Q6NVG7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Colgalt2Q6NVG7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Colgalt2Q6NVG7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms