Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cpsf6Q6NVF9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cpsf6Q6NVF9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cpsf6Q6NVF9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cpsf6Q6NVF9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cpsf6Q6NVF9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cpsf6Q6NVF9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cpsf6Q6NVF9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cpsf6Q6NVF9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cpsf6Q6NVF9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpsf6Q6NVF9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpsf6Q6NVF9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpsf6Q6NVF9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cpsf6Q6NVF9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpsf6Q6NVF9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpsf6Q6NVF9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpsf6Q6NVF9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpsf6Q6NVF9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpsf6Q6NVF9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpsf6Q6NVF9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpsf6Q6NVF9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpsf6Q6NVF9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpsf6Q6NVF9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpsf6Q6NVF9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpsf6Q6NVF9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpsf6Q6NVF9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpsf6Q6NVF9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpsf6Q6NVF9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpsf6Q6NVF9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpsf6Q6NVF9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cpsf6Q6NVF9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cpsf6Q6NVF9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpsf6Q6NVF9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpsf6Q6NVF9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpsf6Q6NVF9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpsf6Q6NVF9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpsf6Q6NVF9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpsf6Q6NVF9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpsf6Q6NVF9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpsf6Q6NVF9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpsf6Q6NVF9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpsf6Q6NVF9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpsf6Q6NVF9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpsf6Q6NVF9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpsf6Q6NVF9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpsf6Q6NVF9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpsf6Q6NVF9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpsf6Q6NVF9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpsf6Q6NVF9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpsf6Q6NVF9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpsf6Q6NVF9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpsf6Q6NVF9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpsf6Q6NVF9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpsf6Q6NVF9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpsf6Q6NVF9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpsf6Q6NVF9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpsf6Q6NVF9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpsf6Q6NVF9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpsf6Q6NVF9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpsf6Q6NVF9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpsf6Q6NVF9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpsf6Q6NVF9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpsf6Q6NVF9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpsf6Q6NVF9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpsf6Q6NVF9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpsf6Q6NVF9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpsf6Q6NVF9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cpsf6Q6NVF9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cpsf6Q6NVF9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cpsf6Q6NVF9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cpsf6Q6NVF9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cpsf6Q6NVF9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cpsf6Q6NVF9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cpsf6Q6NVF9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cpsf6Q6NVF9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cpsf6Q6NVF9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpsf6Q6NVF9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cpsf6Q6NVF9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cpsf6Q6NVF9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cpsf6Q6NVF9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cpsf6Q6NVF9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cpsf6Q6NVF9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cpsf6Q6NVF9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cpsf6Q6NVF9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cpsf6Q6NVF9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cpsf6Q6NVF9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cpsf6Q6NVF9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cpsf6Q6NVF9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cpsf6Q6NVF9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cpsf6Q6NVF9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cpsf6Q6NVF9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cpsf6Q6NVF9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cpsf6Q6NVF9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cpsf6Q6NVF9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cpsf6Q6NVF9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cpsf6Q6NVF9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cpsf6Q6NVF9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cpsf6Q6NVF9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cpsf6Q6NVF9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cpsf6Q6NVF9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms