Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NipblQ6KCD5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NipblQ6KCD5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NipblQ6KCD5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NipblQ6KCD5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NipblQ6KCD5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NipblQ6KCD5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NipblQ6KCD5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NipblQ6KCD5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NipblQ6KCD5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NipblQ6KCD5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NipblQ6KCD5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NipblQ6KCD5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NipblQ6KCD5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NipblQ6KCD5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NipblQ6KCD5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NipblQ6KCD5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NipblQ6KCD5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NipblQ6KCD5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NipblQ6KCD5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NipblQ6KCD5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NipblQ6KCD5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NipblQ6KCD5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NipblQ6KCD5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NipblQ6KCD5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NipblQ6KCD5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NipblQ6KCD5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NipblQ6KCD5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NipblQ6KCD5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NipblQ6KCD5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NipblQ6KCD5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NipblQ6KCD5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NipblQ6KCD5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NipblQ6KCD5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NipblQ6KCD5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NipblQ6KCD5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NipblQ6KCD5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NipblQ6KCD5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NipblQ6KCD5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NipblQ6KCD5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NipblQ6KCD5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NipblQ6KCD5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NipblQ6KCD5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NipblQ6KCD5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NipblQ6KCD5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NipblQ6KCD5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NipblQ6KCD5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NipblQ6KCD5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NipblQ6KCD5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NipblQ6KCD5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NipblQ6KCD5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NipblQ6KCD5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NipblQ6KCD5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NipblQ6KCD5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NipblQ6KCD5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NipblQ6KCD5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NipblQ6KCD5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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