Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q66JV7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Q66JV7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Q66JV7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Q66JV7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Q66JV7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Q66JV7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Q66JV7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Q66JV7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q66JV7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Q66JV7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Q66JV7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Q66JV7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Q66JV7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Q66JV7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Q66JV7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Q66JV7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Q66JV7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Q66JV7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q66JV7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q66JV7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q66JV7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q66JV7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q66JV7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Q66JV7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q66JV7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q66JV7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q66JV7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Q66JV7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Q66JV7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Q66JV7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Q66JV7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Q66JV7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Q66JV7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Q66JV7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Q66JV7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Q66JV7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Q66JV7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Q66JV7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Q66JV7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Q66JV7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Q66JV7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Q66JV7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Q66JV7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Q66JV7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Q66JV7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Q66JV7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Q66JV7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Q66JV7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Q66JV7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Q66JV7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Q66JV7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Q66JV7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Q66JV7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Q66JV7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Q66JV7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Q66JV7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Q66JV7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Q66JV7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Q66JV7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Q66JV7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Q66JV7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Q66JV7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Q66JV7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Q66JV7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Q66JV7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Q66JV7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Q66JV7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Q66JV7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Q66JV7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Q66JV7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q66JV7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q66JV7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Q66JV7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Q66JV7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Q66JV7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Q66JV7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q66JV7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q66JV7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q66JV7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q66JV7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Q66JV7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Q66JV7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Q66JV7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q66JV7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Q66JV7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Q66JV7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q66JV7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q66JV7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q66JV7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Q66JV7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q66JV7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q66JV7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q66JV7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q66JV7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Q66JV7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Q66JV7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Q66JV7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Q66JV7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Q66JV7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms