Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc8eQ66JT1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc8eQ66JT1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc8eQ66JT1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc8eQ66JT1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc8eQ66JT1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc8eQ66JT1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc8eQ66JT1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc8eQ66JT1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc8eQ66JT1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc8eQ66JT1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc8eQ66JT1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc8eQ66JT1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc8eQ66JT1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc8eQ66JT1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc8eQ66JT1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc8eQ66JT1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc8eQ66JT1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc8eQ66JT1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc8eQ66JT1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc8eQ66JT1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc8eQ66JT1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc8eQ66JT1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrc8eQ66JT1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc8eQ66JT1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc8eQ66JT1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc8eQ66JT1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc8eQ66JT1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc8eQ66JT1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc8eQ66JT1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc8eQ66JT1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc8eQ66JT1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc8eQ66JT1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc8eQ66JT1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc8eQ66JT1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc8eQ66JT1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc8eQ66JT1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc8eQ66JT1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc8eQ66JT1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc8eQ66JT1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc8eQ66JT1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc8eQ66JT1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc8eQ66JT1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc8eQ66JT1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc8eQ66JT1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc8eQ66JT1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrc8eQ66JT1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrc8eQ66JT1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc8eQ66JT1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc8eQ66JT1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc8eQ66JT1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc8eQ66JT1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc8eQ66JT1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc8eQ66JT1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc8eQ66JT1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc8eQ66JT1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc8eQ66JT1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc8eQ66JT1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc8eQ66JT1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc8eQ66JT1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc8eQ66JT1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc8eQ66JT1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc8eQ66JT1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc8eQ66JT1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc8eQ66JT1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc8eQ66JT1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc8eQ66JT1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc8eQ66JT1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc8eQ66JT1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc8eQ66JT1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc8eQ66JT1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc8eQ66JT1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc8eQ66JT1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc8eQ66JT1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc8eQ66JT1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc8eQ66JT1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc8eQ66JT1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lrrc8eQ66JT1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lrrc8eQ66JT1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc8eQ66JT1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc8eQ66JT1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc8eQ66JT1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc8eQ66JT1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc8eQ66JT1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc8eQ66JT1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc8eQ66JT1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc8eQ66JT1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc8eQ66JT1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc8eQ66JT1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc8eQ66JT1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc8eQ66JT1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc8eQ66JT1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc8eQ66JT1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc8eQ66JT1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc8eQ66JT1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrrc8eQ66JT1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrrc8eQ66JT1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrc8eQ66JT1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrc8eQ66JT1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc8eQ66JT1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms