Protein–RNA interactions for Protein: Q64332

Syn2, Synapsin-2, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syn2Q64332 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syn2Q64332 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syn2Q64332 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syn2Q64332 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syn2Q64332 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syn2Q64332 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syn2Q64332 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syn2Q64332 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Syn2Q64332 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syn2Q64332 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syn2Q64332 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syn2Q64332 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syn2Q64332 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syn2Q64332 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syn2Q64332 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syn2Q64332 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Syn2Q64332 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syn2Q64332 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syn2Q64332 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syn2Q64332 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syn2Q64332 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syn2Q64332 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Syn2Q64332 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syn2Q64332 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syn2Q64332 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syn2Q64332 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syn2Q64332 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syn2Q64332 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syn2Q64332 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Syn2Q64332 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syn2Q64332 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syn2Q64332 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syn2Q64332 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syn2Q64332 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syn2Q64332 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Syn2Q64332 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Syn2Q64332 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Syn2Q64332 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syn2Q64332 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syn2Q64332 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syn2Q64332 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syn2Q64332 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Syn2Q64332 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Syn2Q64332 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syn2Q64332 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syn2Q64332 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syn2Q64332 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syn2Q64332 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syn2Q64332 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syn2Q64332 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syn2Q64332 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Syn2Q64332 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Syn2Q64332 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Syn2Q64332 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syn2Q64332 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syn2Q64332 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syn2Q64332 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syn2Q64332 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syn2Q64332 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syn2Q64332 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syn2Q64332 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Syn2Q64332 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Syn2Q64332 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Syn2Q64332 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Syn2Q64332 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Syn2Q64332 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Syn2Q64332 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Syn2Q64332 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Syn2Q64332 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Syn2Q64332 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Syn2Q64332 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syn2Q64332 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syn2Q64332 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Syn2Q64332 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Syn2Q64332 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Syn2Q64332 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syn2Q64332 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syn2Q64332 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syn2Q64332 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Syn2Q64332 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Syn2Q64332 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Syn2Q64332 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Syn2Q64332 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Syn2Q64332 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syn2Q64332 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syn2Q64332 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syn2Q64332 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syn2Q64332 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syn2Q64332 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syn2Q64332 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syn2Q64332 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syn2Q64332 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syn2Q64332 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syn2Q64332 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syn2Q64332 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syn2Q64332 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syn2Q64332 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syn2Q64332 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syn2Q64332 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syn2Q64332 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms