Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pou4f3Q63955 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pou4f3Q63955 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pou4f3Q63955 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pou4f3Q63955 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pou4f3Q63955 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pou4f3Q63955 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pou4f3Q63955 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pou4f3Q63955 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pou4f3Q63955 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pou4f3Q63955 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pou4f3Q63955 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pou4f3Q63955 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pou4f3Q63955 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pou4f3Q63955 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pou4f3Q63955 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pou4f3Q63955 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pou4f3Q63955 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pou4f3Q63955 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pou4f3Q63955 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pou4f3Q63955 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pou4f3Q63955 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pou4f3Q63955 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pou4f3Q63955 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pou4f3Q63955 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pou4f3Q63955 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pou4f3Q63955 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pou4f3Q63955 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pou4f3Q63955 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pou4f3Q63955 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pou4f3Q63955 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pou4f3Q63955 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pou4f3Q63955 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pou4f3Q63955 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pou4f3Q63955 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pou4f3Q63955 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pou4f3Q63955 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pou4f3Q63955 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pou4f3Q63955 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pou4f3Q63955 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pou4f3Q63955 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pou4f3Q63955 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pou4f3Q63955 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pou4f3Q63955 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pou4f3Q63955 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pou4f3Q63955 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pou4f3Q63955 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pou4f3Q63955 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pou4f3Q63955 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pou4f3Q63955 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pou4f3Q63955 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pou4f3Q63955 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pou4f3Q63955 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pou4f3Q63955 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pou4f3Q63955 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pou4f3Q63955 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pou4f3Q63955 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pou4f3Q63955 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pou4f3Q63955 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pou4f3Q63955 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pou4f3Q63955 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pou4f3Q63955 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pou4f3Q63955 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pou4f3Q63955 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pou4f3Q63955 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pou4f3Q63955 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pou4f3Q63955 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pou4f3Q63955 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pou4f3Q63955 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pou4f3Q63955 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pou4f3Q63955 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pou4f3Q63955 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pou4f3Q63955 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pou4f3Q63955 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pou4f3Q63955 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pou4f3Q63955 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pou4f3Q63955 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pou4f3Q63955 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pou4f3Q63955 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pou4f3Q63955 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pou4f3Q63955 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pou4f3Q63955 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pou4f3Q63955 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pou4f3Q63955 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pou4f3Q63955 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pou4f3Q63955 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pou4f3Q63955 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pou4f3Q63955 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pou4f3Q63955 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pou4f3Q63955 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pou4f3Q63955 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pou4f3Q63955 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pou4f3Q63955 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pou4f3Q63955 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pou4f3Q63955 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pou4f3Q63955 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pou4f3Q63955 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pou4f3Q63955 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pou4f3Q63955 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pou4f3Q63955 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.4 ms