Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf260Q62513 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf260Q62513 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf260Q62513 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf260Q62513 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf260Q62513 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf260Q62513 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf260Q62513 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf260Q62513 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf260Q62513 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf260Q62513 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf260Q62513 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf260Q62513 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf260Q62513 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf260Q62513 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf260Q62513 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf260Q62513 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf260Q62513 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf260Q62513 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf260Q62513 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf260Q62513 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf260Q62513 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf260Q62513 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf260Q62513 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf260Q62513 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf260Q62513 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf260Q62513 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf260Q62513 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf260Q62513 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf260Q62513 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf260Q62513 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf260Q62513 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf260Q62513 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf260Q62513 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf260Q62513 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf260Q62513 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf260Q62513 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf260Q62513 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf260Q62513 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf260Q62513 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf260Q62513 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf260Q62513 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf260Q62513 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf260Q62513 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf260Q62513 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf260Q62513 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf260Q62513 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf260Q62513 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf260Q62513 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf260Q62513 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf260Q62513 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf260Q62513 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf260Q62513 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf260Q62513 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf260Q62513 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf260Q62513 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf260Q62513 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf260Q62513 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf260Q62513 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf260Q62513 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf260Q62513 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf260Q62513 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf260Q62513 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf260Q62513 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf260Q62513 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf260Q62513 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf260Q62513 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf260Q62513 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf260Q62513 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf260Q62513 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf260Q62513 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf260Q62513 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf260Q62513 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf260Q62513 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf260Q62513 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf260Q62513 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf260Q62513 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf260Q62513 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf260Q62513 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf260Q62513 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf260Q62513 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf260Q62513 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf260Q62513 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf260Q62513 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf260Q62513 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf260Q62513 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf260Q62513 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf260Q62513 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf260Q62513 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf260Q62513 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf260Q62513 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf260Q62513 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf260Q62513 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf260Q62513 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf260Q62513 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf260Q62513 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf260Q62513 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf260Q62513 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf260Q62513 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf260Q62513 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
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