Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vamp1Q62442 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vamp1Q62442 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vamp1Q62442 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vamp1Q62442 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Vamp1Q62442 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp1Q62442 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp1Q62442 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp1Q62442 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp1Q62442 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vamp1Q62442 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Vamp1Q62442 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vamp1Q62442 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp1Q62442 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp1Q62442 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vamp1Q62442 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vamp1Q62442 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vamp1Q62442 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vamp1Q62442 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp1Q62442 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp1Q62442 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp1Q62442 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp1Q62442 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp1Q62442 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp1Q62442 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp1Q62442 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vamp1Q62442 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vamp1Q62442 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vamp1Q62442 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp1Q62442 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp1Q62442 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp1Q62442 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp1Q62442 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vamp1Q62442 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp1Q62442 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp1Q62442 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp1Q62442 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vamp1Q62442 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vamp1Q62442 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vamp1Q62442 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp1Q62442 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vamp1Q62442 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vamp1Q62442 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vamp1Q62442 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vamp1Q62442 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vamp1Q62442 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vamp1Q62442 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vamp1Q62442 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vamp1Q62442 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vamp1Q62442 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vamp1Q62442 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp1Q62442 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp1Q62442 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp1Q62442 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp1Q62442 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp1Q62442 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp1Q62442 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp1Q62442 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp1Q62442 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp1Q62442 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vamp1Q62442 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vamp1Q62442 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vamp1Q62442 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vamp1Q62442 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vamp1Q62442 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vamp1Q62442 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vamp1Q62442 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vamp1Q62442 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vamp1Q62442 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vamp1Q62442 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vamp1Q62442 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vamp1Q62442 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vamp1Q62442 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vamp1Q62442 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vamp1Q62442 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vamp1Q62442 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vamp1Q62442 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vamp1Q62442 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vamp1Q62442 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vamp1Q62442 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vamp1Q62442 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vamp1Q62442 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vamp1Q62442 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vamp1Q62442 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vamp1Q62442 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vamp1Q62442 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vamp1Q62442 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vamp1Q62442 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vamp1Q62442 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vamp1Q62442 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vamp1Q62442 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vamp1Q62442 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vamp1Q62442 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vamp1Q62442 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vamp1Q62442 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vamp1Q62442 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vamp1Q62442 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vamp1Q62442 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vamp1Q62442 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vamp1Q62442 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms