Protein–RNA interactions for Protein: Q62348

Tsn, Translin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsnQ62348 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TsnQ62348 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TsnQ62348 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TsnQ62348 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TsnQ62348 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TsnQ62348 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TsnQ62348 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TsnQ62348 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TsnQ62348 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TsnQ62348 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TsnQ62348 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TsnQ62348 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TsnQ62348 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TsnQ62348 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TsnQ62348 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TsnQ62348 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TsnQ62348 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TsnQ62348 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TsnQ62348 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TsnQ62348 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TsnQ62348 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TsnQ62348 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TsnQ62348 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TsnQ62348 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TsnQ62348 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TsnQ62348 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TsnQ62348 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TsnQ62348 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TsnQ62348 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TsnQ62348 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TsnQ62348 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TsnQ62348 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TsnQ62348 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TsnQ62348 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TsnQ62348 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TsnQ62348 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TsnQ62348 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TsnQ62348 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TsnQ62348 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TsnQ62348 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TsnQ62348 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TsnQ62348 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TsnQ62348 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TsnQ62348 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TsnQ62348 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TsnQ62348 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TsnQ62348 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TsnQ62348 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TsnQ62348 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TsnQ62348 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TsnQ62348 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TsnQ62348 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TsnQ62348 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TsnQ62348 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TsnQ62348 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TsnQ62348 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TsnQ62348 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TsnQ62348 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TsnQ62348 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TsnQ62348 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TsnQ62348 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TsnQ62348 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TsnQ62348 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TsnQ62348 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TsnQ62348 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TsnQ62348 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TsnQ62348 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TsnQ62348 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TsnQ62348 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TsnQ62348 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TsnQ62348 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TsnQ62348 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TsnQ62348 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TsnQ62348 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TsnQ62348 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TsnQ62348 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TsnQ62348 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TsnQ62348 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TsnQ62348 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TsnQ62348 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TsnQ62348 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TsnQ62348 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TsnQ62348 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TsnQ62348 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TsnQ62348 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TsnQ62348 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TsnQ62348 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TsnQ62348 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TsnQ62348 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TsnQ62348 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TsnQ62348 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TsnQ62348 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TsnQ62348 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TsnQ62348 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TsnQ62348 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TsnQ62348 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TsnQ62348 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TsnQ62348 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TsnQ62348 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TsnQ62348 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms