Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sycp1Q62209 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sycp1Q62209 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sycp1Q62209 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sycp1Q62209 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sycp1Q62209 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sycp1Q62209 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sycp1Q62209 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sycp1Q62209 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sycp1Q62209 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sycp1Q62209 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sycp1Q62209 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sycp1Q62209 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sycp1Q62209 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Sycp1Q62209 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sycp1Q62209 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sycp1Q62209 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sycp1Q62209 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sycp1Q62209 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sycp1Q62209 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sycp1Q62209 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sycp1Q62209 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sycp1Q62209 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sycp1Q62209 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sycp1Q62209 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sycp1Q62209 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sycp1Q62209 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sycp1Q62209 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sycp1Q62209 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sycp1Q62209 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sycp1Q62209 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sycp1Q62209 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sycp1Q62209 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sycp1Q62209 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sycp1Q62209 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sycp1Q62209 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sycp1Q62209 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sycp1Q62209 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sycp1Q62209 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sycp1Q62209 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sycp1Q62209 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sycp1Q62209 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sycp1Q62209 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sycp1Q62209 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sycp1Q62209 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sycp1Q62209 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sycp1Q62209 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Sycp1Q62209 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sycp1Q62209 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sycp1Q62209 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Sycp1Q62209 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sycp1Q62209 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sycp1Q62209 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sycp1Q62209 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sycp1Q62209 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sycp1Q62209 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sycp1Q62209 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sycp1Q62209 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sycp1Q62209 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sycp1Q62209 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sycp1Q62209 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sycp1Q62209 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sycp1Q62209 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sycp1Q62209 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sycp1Q62209 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sycp1Q62209 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sycp1Q62209 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sycp1Q62209 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sycp1Q62209 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sycp1Q62209 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sycp1Q62209 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sycp1Q62209 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sycp1Q62209 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sycp1Q62209 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sycp1Q62209 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sycp1Q62209 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sycp1Q62209 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sycp1Q62209 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sycp1Q62209 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sycp1Q62209 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sycp1Q62209 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sycp1Q62209 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sycp1Q62209 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sycp1Q62209 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sycp1Q62209 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sycp1Q62209 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sycp1Q62209 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sycp1Q62209 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sycp1Q62209 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sycp1Q62209 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Sycp1Q62209 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sycp1Q62209 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sycp1Q62209 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sycp1Q62209 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sycp1Q62209 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sycp1Q62209 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sycp1Q62209 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sycp1Q62209 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sycp1Q62209 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sycp1Q62209 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms