Protein–RNA interactions for Protein: Q62191

Trim21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim21Q62191 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim21Q62191 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim21Q62191 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim21Q62191 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim21Q62191 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim21Q62191 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim21Q62191 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim21Q62191 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Trim21Q62191 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim21Q62191 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim21Q62191 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim21Q62191 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim21Q62191 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim21Q62191 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim21Q62191 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim21Q62191 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim21Q62191 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim21Q62191 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trim21Q62191 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim21Q62191 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim21Q62191 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim21Q62191 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim21Q62191 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim21Q62191 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim21Q62191 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim21Q62191 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim21Q62191 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim21Q62191 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim21Q62191 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim21Q62191 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim21Q62191 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim21Q62191 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim21Q62191 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim21Q62191 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim21Q62191 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim21Q62191 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim21Q62191 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim21Q62191 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim21Q62191 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim21Q62191 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim21Q62191 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim21Q62191 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim21Q62191 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim21Q62191 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim21Q62191 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim21Q62191 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim21Q62191 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim21Q62191 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim21Q62191 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim21Q62191 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim21Q62191 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim21Q62191 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim21Q62191 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim21Q62191 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim21Q62191 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim21Q62191 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim21Q62191 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim21Q62191 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim21Q62191 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim21Q62191 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim21Q62191 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim21Q62191 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim21Q62191 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim21Q62191 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim21Q62191 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim21Q62191 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim21Q62191 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim21Q62191 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim21Q62191 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim21Q62191 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim21Q62191 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim21Q62191 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim21Q62191 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim21Q62191 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim21Q62191 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim21Q62191 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim21Q62191 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim21Q62191 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim21Q62191 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim21Q62191 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim21Q62191 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim21Q62191 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim21Q62191 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim21Q62191 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim21Q62191 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim21Q62191 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim21Q62191 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim21Q62191 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim21Q62191 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim21Q62191 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim21Q62191 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim21Q62191 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim21Q62191 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim21Q62191 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim21Q62191 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim21Q62191 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim21Q62191 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim21Q62191 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim21Q62191 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim21Q62191 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms