Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbm38Q62176 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbm38Q62176 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbm38Q62176 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbm38Q62176 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbm38Q62176 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbm38Q62176 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbm38Q62176 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbm38Q62176 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbm38Q62176 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbm38Q62176 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbm38Q62176 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbm38Q62176 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbm38Q62176 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbm38Q62176 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbm38Q62176 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbm38Q62176 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbm38Q62176 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbm38Q62176 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbm38Q62176 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbm38Q62176 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbm38Q62176 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbm38Q62176 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbm38Q62176 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbm38Q62176 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbm38Q62176 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbm38Q62176 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbm38Q62176 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rbm38Q62176 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbm38Q62176 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbm38Q62176 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbm38Q62176 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbm38Q62176 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rbm38Q62176 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbm38Q62176 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbm38Q62176 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbm38Q62176 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rbm38Q62176 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rbm38Q62176 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rbm38Q62176 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbm38Q62176 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbm38Q62176 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbm38Q62176 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbm38Q62176 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbm38Q62176 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbm38Q62176 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbm38Q62176 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbm38Q62176 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbm38Q62176 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbm38Q62176 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbm38Q62176 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbm38Q62176 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbm38Q62176 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbm38Q62176 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbm38Q62176 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbm38Q62176 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbm38Q62176 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbm38Q62176 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbm38Q62176 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbm38Q62176 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rbm38Q62176 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbm38Q62176 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbm38Q62176 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbm38Q62176 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbm38Q62176 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbm38Q62176 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbm38Q62176 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbm38Q62176 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbm38Q62176 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbm38Q62176 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbm38Q62176 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbm38Q62176 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbm38Q62176 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbm38Q62176 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbm38Q62176 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbm38Q62176 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbm38Q62176 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbm38Q62176 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbm38Q62176 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbm38Q62176 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbm38Q62176 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbm38Q62176 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm38Q62176 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm38Q62176 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbm38Q62176 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbm38Q62176 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbm38Q62176 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbm38Q62176 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbm38Q62176 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm38Q62176 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm38Q62176 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm38Q62176 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm38Q62176 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm38Q62176 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbm38Q62176 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbm38Q62176 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbm38Q62176 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbm38Q62176 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbm38Q62176 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbm38Q62176 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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