Protein–RNA interactions for Protein: Q61751

Znf354a, Zinc finger protein 354A, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354aQ61751 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf354aQ61751 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf354aQ61751 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf354aQ61751 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf354aQ61751 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Znf354aQ61751 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf354aQ61751 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf354aQ61751 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf354aQ61751 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf354aQ61751 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf354aQ61751 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf354aQ61751 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf354aQ61751 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf354aQ61751 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf354aQ61751 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf354aQ61751 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf354aQ61751 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf354aQ61751 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf354aQ61751 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf354aQ61751 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf354aQ61751 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf354aQ61751 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf354aQ61751 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf354aQ61751 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf354aQ61751 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf354aQ61751 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf354aQ61751 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf354aQ61751 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf354aQ61751 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf354aQ61751 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf354aQ61751 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf354aQ61751 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf354aQ61751 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf354aQ61751 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf354aQ61751 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf354aQ61751 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf354aQ61751 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf354aQ61751 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf354aQ61751 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf354aQ61751 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf354aQ61751 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf354aQ61751 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf354aQ61751 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf354aQ61751 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf354aQ61751 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf354aQ61751 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf354aQ61751 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf354aQ61751 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf354aQ61751 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf354aQ61751 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf354aQ61751 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf354aQ61751 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf354aQ61751 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf354aQ61751 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf354aQ61751 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf354aQ61751 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf354aQ61751 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf354aQ61751 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf354aQ61751 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf354aQ61751 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf354aQ61751 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf354aQ61751 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf354aQ61751 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Znf354aQ61751 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf354aQ61751 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf354aQ61751 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf354aQ61751 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf354aQ61751 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf354aQ61751 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf354aQ61751 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf354aQ61751 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Znf354aQ61751 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf354aQ61751 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf354aQ61751 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf354aQ61751 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf354aQ61751 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf354aQ61751 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf354aQ61751 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf354aQ61751 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Znf354aQ61751 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf354aQ61751 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf354aQ61751 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf354aQ61751 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf354aQ61751 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf354aQ61751 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf354aQ61751 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf354aQ61751 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf354aQ61751 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf354aQ61751 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf354aQ61751 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf354aQ61751 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf354aQ61751 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf354aQ61751 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf354aQ61751 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf354aQ61751 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf354aQ61751 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf354aQ61751 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf354aQ61751 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf354aQ61751 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf354aQ61751 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms