Protein–RNA interactions for Protein: Q61656

Ddx5, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx5Q61656 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx5Q61656 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx5Q61656 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx5Q61656 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx5Q61656 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx5Q61656 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddx5Q61656 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddx5Q61656 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddx5Q61656 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx5Q61656 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx5Q61656 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx5Q61656 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx5Q61656 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx5Q61656 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx5Q61656 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx5Q61656 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx5Q61656 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx5Q61656 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx5Q61656 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx5Q61656 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx5Q61656 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx5Q61656 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx5Q61656 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx5Q61656 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx5Q61656 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx5Q61656 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx5Q61656 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx5Q61656 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx5Q61656 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx5Q61656 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ddx5Q61656 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddx5Q61656 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddx5Q61656 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddx5Q61656 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddx5Q61656 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddx5Q61656 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddx5Q61656 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddx5Q61656 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddx5Q61656 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddx5Q61656 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddx5Q61656 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddx5Q61656 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddx5Q61656 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddx5Q61656 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddx5Q61656 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx5Q61656 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx5Q61656 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx5Q61656 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx5Q61656 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx5Q61656 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx5Q61656 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx5Q61656 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx5Q61656 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx5Q61656 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx5Q61656 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx5Q61656 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx5Q61656 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx5Q61656 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx5Q61656 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx5Q61656 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx5Q61656 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx5Q61656 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx5Q61656 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx5Q61656 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx5Q61656 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx5Q61656 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx5Q61656 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx5Q61656 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx5Q61656 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx5Q61656 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx5Q61656 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ddx5Q61656 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ddx5Q61656 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx5Q61656 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx5Q61656 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx5Q61656 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx5Q61656 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx5Q61656 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx5Q61656 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx5Q61656 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx5Q61656 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx5Q61656 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx5Q61656 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx5Q61656 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx5Q61656 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx5Q61656 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx5Q61656 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx5Q61656 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx5Q61656 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx5Q61656 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx5Q61656 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx5Q61656 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx5Q61656 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx5Q61656 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx5Q61656 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx5Q61656 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx5Q61656 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx5Q61656 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx5Q61656 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx5Q61656 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms