Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Gli3Q61602 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Gli3Q61602 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
Gli3Q61602 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Gli3Q61602 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Gli3Q61602 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Gli3Q61602 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Gli3Q61602 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Gli3Q61602 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Gli3Q61602 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Gli3Q61602 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Gli3Q61602 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Gli3Q61602 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Gli3Q61602 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Gli3Q61602 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Gli3Q61602 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Gli3Q61602 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Gli3Q61602 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Gli3Q61602 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Gli3Q61602 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Gli3Q61602 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Gli3Q61602 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Gli3Q61602 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Gli3Q61602 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Gli3Q61602 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Gli3Q61602 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Gli3Q61602 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Gli3Q61602 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Gli3Q61602 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Gli3Q61602 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Gli3Q61602 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Gli3Q61602 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Gli3Q61602 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Gli3Q61602 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Gli3Q61602 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Gli3Q61602 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Gli3Q61602 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Gli3Q61602 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Gli3Q61602 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Gli3Q61602 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Gli3Q61602 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Gli3Q61602 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Gli3Q61602 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Gli3Q61602 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Gli3Q61602 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Gli3Q61602 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Gli3Q61602 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Gli3Q61602 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Gli3Q61602 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Gli3Q61602 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Gli3Q61602 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Gli3Q61602 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Gli3Q61602 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Gli3Q61602 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Gli3Q61602 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Gli3Q61602 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Gli3Q61602 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Gli3Q61602 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Gli3Q61602 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Gli3Q61602 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Gli3Q61602 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Gli3Q61602 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Gli3Q61602 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Gli3Q61602 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Gli3Q61602 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Gli3Q61602 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Gli3Q61602 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Gli3Q61602 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Gli3Q61602 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Gli3Q61602 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Gli3Q61602 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Gli3Q61602 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Gli3Q61602 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Gli3Q61602 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Gli3Q61602 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Gli3Q61602 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Gli3Q61602 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Gli3Q61602 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Gli3Q61602 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Gli3Q61602 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Gli3Q61602 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Gli3Q61602 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Gli3Q61602 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Gli3Q61602 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Gli3Q61602 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Gli3Q61602 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Gli3Q61602 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Gli3Q61602 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Gli3Q61602 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Gli3Q61602 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Gli3Q61602 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Gli3Q61602 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Gli3Q61602 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Gli3Q61602 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Gli3Q61602 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Gli3Q61602 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Gli3Q61602 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Gli3Q61602 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Gli3Q61602 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Gli3Q61602 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms