Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ift88Q61371 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ift88Q61371 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ift88Q61371 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ift88Q61371 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ift88Q61371 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ift88Q61371 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ift88Q61371 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ift88Q61371 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ift88Q61371 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ift88Q61371 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ift88Q61371 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ift88Q61371 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ift88Q61371 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ift88Q61371 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ift88Q61371 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ift88Q61371 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ift88Q61371 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ift88Q61371 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ift88Q61371 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ift88Q61371 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ift88Q61371 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ift88Q61371 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ift88Q61371 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ift88Q61371 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ift88Q61371 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ift88Q61371 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ift88Q61371 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ift88Q61371 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ift88Q61371 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ift88Q61371 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ift88Q61371 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ift88Q61371 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ift88Q61371 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ift88Q61371 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ift88Q61371 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ift88Q61371 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ift88Q61371 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ift88Q61371 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ift88Q61371 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ift88Q61371 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ift88Q61371 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ift88Q61371 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ift88Q61371 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ift88Q61371 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ift88Q61371 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ift88Q61371 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ift88Q61371 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ift88Q61371 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ift88Q61371 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ift88Q61371 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ift88Q61371 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ift88Q61371 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ift88Q61371 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ift88Q61371 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ift88Q61371 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ift88Q61371 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ift88Q61371 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ift88Q61371 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ift88Q61371 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ift88Q61371 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ift88Q61371 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ift88Q61371 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ift88Q61371 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ift88Q61371 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ift88Q61371 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ift88Q61371 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ift88Q61371 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ift88Q61371 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ift88Q61371 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ift88Q61371 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ift88Q61371 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ift88Q61371 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ift88Q61371 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ift88Q61371 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ift88Q61371 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ift88Q61371 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ift88Q61371 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ift88Q61371 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ift88Q61371 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ift88Q61371 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ift88Q61371 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ift88Q61371 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ift88Q61371 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ift88Q61371 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ift88Q61371 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ift88Q61371 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ift88Q61371 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ift88Q61371 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ift88Q61371 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ift88Q61371 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ift88Q61371 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ift88Q61371 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ift88Q61371 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ift88Q61371 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ift88Q61371 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ift88Q61371 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ift88Q61371 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ift88Q61371 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ift88Q61371 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms