Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Mre11Q61216 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Mre11Q61216 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Mre11Q61216 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Mre11Q61216 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Mre11Q61216 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Mre11Q61216 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mre11Q61216 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Mre11Q61216 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Mre11Q61216 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Mre11Q61216 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mre11Q61216 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mre11Q61216 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mre11Q61216 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mre11Q61216 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Mre11Q61216 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Mre11Q61216 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Mre11Q61216 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Mre11Q61216 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Mre11Q61216 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Mre11Q61216 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Mre11Q61216 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Mre11Q61216 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Mre11Q61216 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Mre11Q61216 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Mre11Q61216 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Mre11Q61216 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Mre11Q61216 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Mre11Q61216 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Mre11Q61216 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Mre11Q61216 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Mre11Q61216 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Mre11Q61216 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Mre11Q61216 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Mre11Q61216 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Mre11Q61216 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Mre11Q61216 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mre11Q61216 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Mre11Q61216 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Mre11Q61216 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Mre11Q61216 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Mre11Q61216 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mre11Q61216 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mre11Q61216 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Mre11Q61216 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Mre11Q61216 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Mre11Q61216 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Mre11Q61216 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Mre11Q61216 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Mre11Q61216 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Mre11Q61216 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mre11Q61216 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mre11Q61216 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mre11Q61216 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Mre11Q61216 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mre11Q61216 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mre11Q61216 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mre11Q61216 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Mre11Q61216 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Mre11Q61216 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Mre11Q61216 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Mre11Q61216 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mre11Q61216 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mre11Q61216 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mre11Q61216 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mre11Q61216 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Mre11Q61216 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Mre11Q61216 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Mre11Q61216 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Mre11Q61216 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Mre11Q61216 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Mre11Q61216 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Mre11Q61216 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Mre11Q61216 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mre11Q61216 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mre11Q61216 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mre11Q61216 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mre11Q61216 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mre11Q61216 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Mre11Q61216 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Mre11Q61216 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Mre11Q61216 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Mre11Q61216 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mre11Q61216 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mre11Q61216 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mre11Q61216 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Mre11Q61216 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mre11Q61216 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mre11Q61216 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mre11Q61216 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mre11Q61216 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Mre11Q61216 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Mre11Q61216 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Mre11Q61216 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Mre11Q61216 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Mre11Q61216 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Mre11Q61216 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Mre11Q61216 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Mre11Q61216 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mre11Q61216 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms