Protein–RNA interactions for Protein: Q61079

Sim2, Single-minded homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim2Q61079 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sim2Q61079 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sim2Q61079 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sim2Q61079 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sim2Q61079 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sim2Q61079 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sim2Q61079 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sim2Q61079 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sim2Q61079 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sim2Q61079 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sim2Q61079 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sim2Q61079 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sim2Q61079 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sim2Q61079 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sim2Q61079 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sim2Q61079 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sim2Q61079 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sim2Q61079 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sim2Q61079 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sim2Q61079 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sim2Q61079 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sim2Q61079 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sim2Q61079 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sim2Q61079 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sim2Q61079 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sim2Q61079 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sim2Q61079 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sim2Q61079 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sim2Q61079 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sim2Q61079 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sim2Q61079 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sim2Q61079 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sim2Q61079 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sim2Q61079 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sim2Q61079 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sim2Q61079 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sim2Q61079 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sim2Q61079 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sim2Q61079 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sim2Q61079 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sim2Q61079 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sim2Q61079 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sim2Q61079 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sim2Q61079 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sim2Q61079 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sim2Q61079 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sim2Q61079 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sim2Q61079 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sim2Q61079 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sim2Q61079 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sim2Q61079 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sim2Q61079 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sim2Q61079 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sim2Q61079 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sim2Q61079 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sim2Q61079 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sim2Q61079 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sim2Q61079 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sim2Q61079 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sim2Q61079 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sim2Q61079 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sim2Q61079 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sim2Q61079 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sim2Q61079 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sim2Q61079 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Sim2Q61079 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sim2Q61079 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sim2Q61079 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sim2Q61079 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sim2Q61079 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sim2Q61079 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sim2Q61079 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sim2Q61079 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sim2Q61079 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sim2Q61079 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sim2Q61079 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sim2Q61079 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sim2Q61079 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sim2Q61079 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sim2Q61079 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sim2Q61079 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sim2Q61079 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sim2Q61079 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Sim2Q61079 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sim2Q61079 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sim2Q61079 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sim2Q61079 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sim2Q61079 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Sim2Q61079 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sim2Q61079 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sim2Q61079 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sim2Q61079 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sim2Q61079 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sim2Q61079 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sim2Q61079 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sim2Q61079 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sim2Q61079 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sim2Q61079 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sim2Q61079 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sim2Q61079 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms