Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klf3Q60980 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klf3Q60980 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klf3Q60980 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klf3Q60980 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klf3Q60980 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klf3Q60980 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klf3Q60980 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klf3Q60980 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klf3Q60980 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klf3Q60980 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Klf3Q60980 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klf3Q60980 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klf3Q60980 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klf3Q60980 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klf3Q60980 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klf3Q60980 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klf3Q60980 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klf3Q60980 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klf3Q60980 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klf3Q60980 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klf3Q60980 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klf3Q60980 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klf3Q60980 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klf3Q60980 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klf3Q60980 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Klf3Q60980 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klf3Q60980 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klf3Q60980 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klf3Q60980 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Klf3Q60980 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Klf3Q60980 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klf3Q60980 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klf3Q60980 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klf3Q60980 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klf3Q60980 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klf3Q60980 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klf3Q60980 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klf3Q60980 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klf3Q60980 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klf3Q60980 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klf3Q60980 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klf3Q60980 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klf3Q60980 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klf3Q60980 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klf3Q60980 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klf3Q60980 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klf3Q60980 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klf3Q60980 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klf3Q60980 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klf3Q60980 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klf3Q60980 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klf3Q60980 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klf3Q60980 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Klf3Q60980 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klf3Q60980 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klf3Q60980 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klf3Q60980 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klf3Q60980 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klf3Q60980 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klf3Q60980 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klf3Q60980 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klf3Q60980 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klf3Q60980 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klf3Q60980 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klf3Q60980 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klf3Q60980 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klf3Q60980 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klf3Q60980 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klf3Q60980 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klf3Q60980 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klf3Q60980 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klf3Q60980 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klf3Q60980 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klf3Q60980 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klf3Q60980 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klf3Q60980 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klf3Q60980 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Klf3Q60980 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klf3Q60980 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klf3Q60980 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klf3Q60980 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Klf3Q60980 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klf3Q60980 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klf3Q60980 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klf3Q60980 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klf3Q60980 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klf3Q60980 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klf3Q60980 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klf3Q60980 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klf3Q60980 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klf3Q60980 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klf3Q60980 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klf3Q60980 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klf3Q60980 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klf3Q60980 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klf3Q60980 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klf3Q60980 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klf3Q60980 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klf3Q60980 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms