Protein–RNA interactions for Protein: Q60967

Papss1, Bifunctional 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papss1Q60967 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Papss1Q60967 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Papss1Q60967 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Papss1Q60967 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Papss1Q60967 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Papss1Q60967 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Papss1Q60967 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Papss1Q60967 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Papss1Q60967 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Papss1Q60967 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Papss1Q60967 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Papss1Q60967 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Papss1Q60967 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Papss1Q60967 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Papss1Q60967 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Papss1Q60967 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Papss1Q60967 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Papss1Q60967 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Papss1Q60967 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Papss1Q60967 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Papss1Q60967 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Papss1Q60967 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Papss1Q60967 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Papss1Q60967 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Papss1Q60967 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Papss1Q60967 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Papss1Q60967 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Papss1Q60967 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Papss1Q60967 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Papss1Q60967 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Papss1Q60967 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Papss1Q60967 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Papss1Q60967 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Papss1Q60967 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Papss1Q60967 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Papss1Q60967 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Papss1Q60967 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Papss1Q60967 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Papss1Q60967 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Papss1Q60967 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Papss1Q60967 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Papss1Q60967 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Papss1Q60967 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Papss1Q60967 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Papss1Q60967 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Papss1Q60967 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Papss1Q60967 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Papss1Q60967 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Papss1Q60967 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Papss1Q60967 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Papss1Q60967 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Papss1Q60967 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Papss1Q60967 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Papss1Q60967 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Papss1Q60967 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Papss1Q60967 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Papss1Q60967 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Papss1Q60967 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Papss1Q60967 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Papss1Q60967 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Papss1Q60967 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Papss1Q60967 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Papss1Q60967 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Papss1Q60967 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Papss1Q60967 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Papss1Q60967 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Papss1Q60967 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Papss1Q60967 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Papss1Q60967 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Papss1Q60967 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Papss1Q60967 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Papss1Q60967 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Papss1Q60967 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Papss1Q60967 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Papss1Q60967 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Papss1Q60967 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Papss1Q60967 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Papss1Q60967 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Papss1Q60967 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Papss1Q60967 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Papss1Q60967 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Papss1Q60967 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Papss1Q60967 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Papss1Q60967 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Papss1Q60967 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Papss1Q60967 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Papss1Q60967 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Papss1Q60967 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Papss1Q60967 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Papss1Q60967 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Papss1Q60967 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Papss1Q60967 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Papss1Q60967 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Papss1Q60967 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Papss1Q60967 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Papss1Q60967 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Papss1Q60967 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Papss1Q60967 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Papss1Q60967 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Papss1Q60967 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms