Protein–RNA interactions for Protein: Q60865

Caprin1, Caprin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin1Q60865 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Caprin1Q60865 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Caprin1Q60865 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Caprin1Q60865 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Caprin1Q60865 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Caprin1Q60865 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Caprin1Q60865 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Caprin1Q60865 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Caprin1Q60865 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Caprin1Q60865 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Caprin1Q60865 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Caprin1Q60865 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Caprin1Q60865 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Caprin1Q60865 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Caprin1Q60865 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Caprin1Q60865 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Caprin1Q60865 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Caprin1Q60865 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Caprin1Q60865 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Caprin1Q60865 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Caprin1Q60865 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Caprin1Q60865 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Caprin1Q60865 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Caprin1Q60865 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Caprin1Q60865 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Caprin1Q60865 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Caprin1Q60865 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Caprin1Q60865 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Caprin1Q60865 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Caprin1Q60865 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Caprin1Q60865 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Caprin1Q60865 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Caprin1Q60865 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Caprin1Q60865 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Caprin1Q60865 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Caprin1Q60865 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Caprin1Q60865 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Caprin1Q60865 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Caprin1Q60865 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Caprin1Q60865 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Caprin1Q60865 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Caprin1Q60865 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Caprin1Q60865 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Caprin1Q60865 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Caprin1Q60865 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Caprin1Q60865 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Caprin1Q60865 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Caprin1Q60865 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Caprin1Q60865 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Caprin1Q60865 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Caprin1Q60865 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Caprin1Q60865 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Caprin1Q60865 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Caprin1Q60865 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Caprin1Q60865 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Caprin1Q60865 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Caprin1Q60865 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Caprin1Q60865 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Caprin1Q60865 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Caprin1Q60865 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Caprin1Q60865 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Caprin1Q60865 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Caprin1Q60865 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Caprin1Q60865 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Caprin1Q60865 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Caprin1Q60865 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Caprin1Q60865 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Caprin1Q60865 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Caprin1Q60865 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Caprin1Q60865 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Caprin1Q60865 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Caprin1Q60865 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Caprin1Q60865 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Caprin1Q60865 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Caprin1Q60865 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Caprin1Q60865 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Caprin1Q60865 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Caprin1Q60865 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Caprin1Q60865 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Caprin1Q60865 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Caprin1Q60865 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Caprin1Q60865 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Caprin1Q60865 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Caprin1Q60865 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Caprin1Q60865 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Caprin1Q60865 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Caprin1Q60865 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Caprin1Q60865 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Caprin1Q60865 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Caprin1Q60865 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Caprin1Q60865 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Caprin1Q60865 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Caprin1Q60865 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Caprin1Q60865 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Caprin1Q60865 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Caprin1Q60865 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Caprin1Q60865 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Caprin1Q60865 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Caprin1Q60865 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Caprin1Q60865 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms